More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2627 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
102 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2808  transcriptional regulator, ArsR family  92.16 
 
 
101 aa  180  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.598578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2713  transcriptional regulator, ArsR family  89.22 
 
 
102 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2592  regulatory protein ArsR  67.35 
 
 
123 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.108396 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0327  regulatory protein ArsR  38.46 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  45.68 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4453  ArsR family transcriptional regulator  44.58 
 
 
233 aa  63.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
98 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  48.68 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  52.05 
 
 
122 aa  62  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0462  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
253 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
114 aa  61.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  50.7 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  37.63 
 
 
115 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  45.56 
 
 
121 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5228  transcriptional regulator, ArsR family  31.87 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
107 aa  57.8  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
107 aa  57.8  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2225  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
114 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.666474  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0756  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
221 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  46.58 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  38.95 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  35.11 
 
 
227 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1075  regulatory protein, ArsR  42.03 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122284  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1106  regulatory protein ArsR  36.9 
 
 
103 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  40 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0599  TrmB/ArsR family transcriptional regulator  48.19 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  40 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  38.89 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  36.54 
 
 
111 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
341 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
341 aa  54.7  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  36.78 
 
 
114 aa  54.7  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0234  ArsR family transcriptional regulator  45.07 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
110 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3666  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
116 aa  53.5  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0183  transcriptional regulator  32.97 
 
 
118 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  41.67 
 
 
106 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
106 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  43.66 
 
 
341 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  42.25 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3434  regulatory protein ArsR  33.7 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5676  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7113  transcriptional regulator, TrmB  45.83 
 
 
105 aa  52.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0721049  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0623  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
223 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128738 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1931  ArsR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0246294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 
112 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
221 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1286  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  36.08 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 
104 aa  52  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  41.25 
 
 
211 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
125 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  40.26 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  38.04 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  37.04 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
97 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  34.38 
 
 
125 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 
99 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 
124 aa  51.6  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0989  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 
105 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0674458  normal  0.0533659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  31.33 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  37.5 
 
 
99 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  36.25 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  36.25 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0477  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000000263262  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  39.71 
 
 
305 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  35.44 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  30 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  30.34 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4112  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.919638 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  34.85 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
120 aa  50.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1142  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 
109 aa  50.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.629326  normal  0.465859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>