More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0599 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0599  TrmB/ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 128 aa  245  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13776  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.355542 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  45.88 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  47.71 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1741  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0480  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0108431  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  46.51 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0581  ArsR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2197  transcriptional regulator, ArsR family  45.05 
 
 		 102 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2149  ArsR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0595  ArsR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.91052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0544  transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  41.18 
 
 		 121 aa  73.9  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1755  transcriptional regulator CzrA  34.02 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.952937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  44.19 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  44.19 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2087  transcriptional regulator  47.06 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13920  transcriptional regulator, ArsR family  47.13 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.836501  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2461  transcriptional regulator, ArsR family  39.77 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.813526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4462  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  38.82 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2654  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4447  ArsR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2219  regulatory protein ArsR  35.56 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.372168  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09790  predicted transcriptional regulator  47.19 
 
 		 145 aa  70.1  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.829992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9265  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.82 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2181  regulatory protein, ArsR  35.56 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  40.48 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  40.48 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  39.6 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0100  ArsR family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  40.22 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1382  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  40.22 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3693  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  44.71 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  38.46 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1168  transcriptional regulator, ArsR family  49.4 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315565  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2262  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1821  transcriptional regulator, ArsR family  39.76 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.321191  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0525  regulatory protein, ArsR  39.47 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.150899 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  34.12 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0205  ArsR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  42.02 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  51.28 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1470  transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 		 119 aa  67.4  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.967801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1628  transcriptional regulator, ArsR family  45.24 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.548833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1258  cadmium efflux system accessory protein  31.68 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1291  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.217446 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0432  ArsR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.35069  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  33.91 
 
 		 141 aa  67  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  39.33 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0802  regulatory protein ArsR  39.29 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0245  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1965  ArsR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1516  transcriptional regulator, ArsR family  36.46 
 
 		 111 aa  65.1  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000659197  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  34.52 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0747  ArsR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  32.18 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4283  transcriptional regulator, ArsR family  49.47 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302443  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  35.64 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4581  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1714  transcriptional regulator, ArsR family  42.57 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388978  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2584  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1232  regulatory protein ArsR  42.35 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.802092  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1854  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3766  cadmium efflux system accessory protein  36.14 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0470  transcriptional regulator, ArsR family  41.86 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000466347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1528  regulatory protein, ArsR  33.72 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00003097  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0341  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000827961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1137  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1719  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0548  transcriptional regulator, ArsR family  36.14 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4451  ArsR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4265  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783067  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3827  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2559  transcriptional regulator, ArsR family  31.07 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0894  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360757  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  41.94 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>