More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1808 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  86.95 
 
 		 745 aa  1235    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  96.83 
 
 		 726 aa  1371    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 725 aa  1458    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  96.56 
 
 		 726 aa  1355    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  46.09 
 
 		 669 aa  561  1e-158  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  43.1 
 
 		 655 aa  503  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  41.87 
 
 		 668 aa  479  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  40.17 
 
 		 681 aa  443  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  38.2 
 
 		 754 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  39.45 
 
 		 648 aa  432  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  39.45 
 
 		 648 aa  432  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  37.99 
 
 		 656 aa  417  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1306  ATP-dependent DNA helicase  42.24 
 
 		 702 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0100895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  35.8 
 
 		 706 aa  414  1e-114  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  36.44 
 
 		 630 aa  404  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  38.62 
 
 		 714 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  39.91 
 
 		 700 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  41.96 
 
 		 725 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3295  UvrD/REP helicase  39.91 
 
 		 717 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.763792  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  41.37 
 
 		 702 aa  392  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5901  UvrD/REP helicase  38.69 
 
 		 689 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0361362  normal  0.5857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2743  UvrD/REP helicase  40.19 
 
 		 688 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7513  ATP-dependent DNA helicase Rep  39.79 
 
 		 686 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.556127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3335  UvrD/REP helicase  39.97 
 
 		 694 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.667259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3142  UvrD/REP helicase  41.37 
 
 		 687 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1045  putative DNA helicase  40.56 
 
 		 708 aa  385  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3768  UvrD/REP helicase  39.94 
 
 		 689 aa  382  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528765  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0548  UvrD/REP helicase  41.29 
 
 		 745 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254513  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  39.01 
 
 		 719 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2939  UvrD/REP helicase  40.03 
 
 		 720 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0258  UvrD/REP helicase  40.31 
 
 		 685 aa  379  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0801  UvrD/REP helicase  39.75 
 
 		 750 aa  376  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2701  UvrD/REP helicase  40.22 
 
 		 686 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.311884  normal  0.28531 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2469  UvrD/REP helicase  37.74 
 
 		 724 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5744  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0402  UvrD/REP helicase  39.94 
 
 		 712 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0230  UvrD/REP helicase  40.41 
 
 		 686 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05321  ATP-dependent DNA helicase II protein  36.81 
 
 		 710 aa  361  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2745  UvrD/REP helicase  39.43 
 
 		 687 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223218  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  36.23 
 
 		 719 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4129  UvrD/REP helicase  36.83 
 
 		 716 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.188822 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4241  UvrD/REP helicase  36.83 
 
 		 716 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  35.49 
 
 		 742 aa  354  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1017  UvrD/REP helicase  34.7 
 
 		 733 aa  353  8.999999999999999e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0594  UvrD/REP helicase  39.78 
 
 		 676 aa  352  8.999999999999999e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  37.43 
 
 		 707 aa  348  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.09 
 
 		 729 aa  347  4e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  33.56 
 
 		 755 aa  345  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  37.78 
 
 		 768 aa  344  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  33 
 
 		 749 aa  342  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  33.74 
 
 		 764 aa  339  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.25 
 
 		 732 aa  335  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  32.77 
 
 		 773 aa  334  3e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  36.3 
 
 		 736 aa  333  6e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.64 
 
 		 694 aa  332  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  31.9 
 
 		 769 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  32.95 
 
 		 735 aa  329  1.0000000000000001e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  37.78 
 
 		 746 aa  328  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1967  UvrD/REP helicase  36.07 
 
 		 789 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.38 
 
 		 741 aa  327  5e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.02 
 
 		 755 aa  327  6e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  34.95 
 
 		 783 aa  326  8.000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  33.84 
 
 		 762 aa  326  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.85 
 
 		 737 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.78 
 
 		 730 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  34.55 
 
 		 789 aa  324  3e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  36.38 
 
 		 741 aa  324  4e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  33.38 
 
 		 779 aa  324  4e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  33.74 
 
 		 666 aa  323  8e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  36.87 
 
 		 705 aa  322  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  36.23 
 
 		 739 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.74 
 
 		 741 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  37.85 
 
 		 768 aa  321  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  38.05 
 
 		 659 aa  318  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.73 
 
 		 753 aa  318  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  33.54 
 
 		 625 aa  317  4e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.73 
 
 		 753 aa  317  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.13 
 
 		 715 aa  317  5e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  33.23 
 
 		 753 aa  317  7e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.23 
 
 		 751 aa  317  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.23 
 
 		 751 aa  316  8e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.23 
 
 		 747 aa  316  8e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  33.23 
 
 		 751 aa  316  9e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.23 
 
 		 747 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.39 
 
 		 742 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  32.51 
 
 		 724 aa  315  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.23 
 
 		 751 aa  316  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34 
 
 		 747 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.33 
 
 		 711 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  35.75 
 
 		 688 aa  314  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.96 
 
 		 718 aa  314  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  35.39 
 
 		 726 aa  314  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  34.37 
 
 		 738 aa  313  6.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.18 
 
 		 785 aa  313  6.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.59 
 
 		 772 aa  313  6.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  32.05 
 
 		 639 aa  313  7.999999999999999e-84  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.91 
 
 		 833 aa  313  9e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  32.07 
 
 		 731 aa  313  9e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  34.18 
 
 		 765 aa  311  2e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  34.07 
 
 		 714 aa  311  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  33.01 
 
 		 758 aa  311  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>