98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1188 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1188  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  712    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  92.76 
 
 		 378 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  92.76 
 
 		 378 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  26.45 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  27.04 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  24.84 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  32.1 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  26.18 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  22.94 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  34.41 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  26.32 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  24.83 
 
 		 392 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  24.77 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  30.25 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  30.25 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  23.91 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 391 aa  73.2  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  26.56 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  24.23 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  24.78 
 
 		 382 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  26.98 
 
 		 383 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  27.01 
 
 		 780 aa  70.1  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  25.82 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  23.4 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  28.8 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 		 384 aa  67  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 		 417 aa  67  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  27.72 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  25.82 
 
 		 491 aa  66.2  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  28.95 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  26.21 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  26.35 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  23.19 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  25.23 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 383 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  31.08 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  24.59 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  24.52 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  23.92 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  26.8 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  27.04 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  25.42 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  27.03 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  23.81 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  23.42 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  22.67 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  23.61 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  22.64 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  22.67 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  23.02 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  27.33 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  23.81 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  23.92 
 
 		 379 aa  56.6  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 367 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  28.39 
 
 		 429 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  28.39 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  25.4 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  28.39 
 
 		 431 aa  53.5  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  28.36 
 
 		 435 aa  52.8  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  24.92 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  25.81 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  26.78 
 
 		 383 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  24.62 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  29.93 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 		 496 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  27.35 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.12 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  21.84 
 
 		 382 aa  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 		 430 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  26.45 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 384 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0341  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  25.16 
 
 		 373 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  26.53 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  19.82 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  20.43 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1223  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0364  ABC-2 type transporter  27.71 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  28.32 
 
 		 381 aa  44.3  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  25.16 
 
 		 378 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  27.21 
 
 		 374 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.05 
 
 		 907 aa  43.5  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  23.24 
 
 		 378 aa  43.1  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 		 369 aa  42.7  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  29.1 
 
 		 390 aa  42.7  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>