More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1407 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  54.4 
 
 		 268 aa  204  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  52.94 
 
 		 211 aa  191  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  47.12 
 
 		 242 aa  190  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  52.41 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  47.55 
 
 		 277 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  56.11 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  56.11 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  56.11 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  56.11 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  56.11 
 
 		 198 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  56.67 
 
 		 198 aa  188  4e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  53.12 
 
 		 198 aa  185  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  53.12 
 
 		 198 aa  185  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  52.94 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  56.67 
 
 		 197 aa  184  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  56.98 
 
 		 198 aa  184  8e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  55 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  55 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  55 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  56.04 
 
 		 198 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  55 
 
 		 198 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  52.6 
 
 		 198 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  48.74 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  54.44 
 
 		 198 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  47.94 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  54.44 
 
 		 198 aa  181  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  54.44 
 
 		 198 aa  181  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  52.04 
 
 		 214 aa  181  8.000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  54.44 
 
 		 198 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  54.44 
 
 		 198 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  54.44 
 
 		 198 aa  181  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  46.46 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  53.65 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  54.44 
 
 		 198 aa  179  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  51.79 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2218  ribonuclease HII  52.31 
 
 		 209 aa  177  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000329039  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  53.89 
 
 		 198 aa  177  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  51.67 
 
 		 193 aa  177  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  51.63 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  45.96 
 
 		 211 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  51.09 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  45.99 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  52.13 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  51.6 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  53.26 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  53.23 
 
 		 218 aa  175  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  51.6 
 
 		 218 aa  175  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2022  ribonuclease H  49.46 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  51.6 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  49.22 
 
 		 217 aa  174  5e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  52.79 
 
 		 260 aa  175  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 211 aa  175  5e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  53.26 
 
 		 201 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  50.79 
 
 		 199 aa  174  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  51.1 
 
 		 202 aa  174  8e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  51.1 
 
 		 202 aa  174  8e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2443  ribonuclease HII  55 
 
 		 193 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0013683  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  51.06 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  51.06 
 
 		 203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0388  ribonuclease HII  48.76 
 
 		 222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.49671  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01386  ribonuclease HII  51.6 
 
 		 190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00865993  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  52.72 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  52.72 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  52.72 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  52.15 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  52.72 
 
 		 210 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  53.33 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  52.22 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  52.46 
 
 		 248 aa  171  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1449  ribonuclease HII  49.21 
 
 		 226 aa  171  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000143368  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  53.33 
 
 		 214 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  51.03 
 
 		 229 aa  171  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  53.33 
 
 		 214 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  50.77 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  51.06 
 
 		 218 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  52.33 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  52.46 
 
 		 248 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1272  ribonuclease H  50.54 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  49.48 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  51.06 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  46.53 
 
 		 212 aa  169  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  52.72 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  47.4 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  53.04 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  43.22 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1375  ribonuclease HII  46.28 
 
 		 198 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000308633  normal  0.450716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  42.71 
 
 		 257 aa  168  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1481  Ribonuclease H  54.19 
 
 		 226 aa  168  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  48.99 
 
 		 229 aa  168  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  48.89 
 
 		 198 aa  167  7e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  53.89 
 
 		 197 aa  167  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  47.03 
 
 		 308 aa  167  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  53.07 
 
 		 191 aa  167  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1478  ribonuclease H  45.13 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  53.07 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  44.62 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0976  ribonuclease H  54.26 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>