More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4736 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2756  threonyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
635 aa  652    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323332  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0623  threonyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 
662 aa  658    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1515  threonyl-tRNA synthetase  49.92 
 
 
636 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00436769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2230  threonyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
636 aa  663    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00712554 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 
638 aa  642    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2628  threonyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 
645 aa  671    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000255721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0185  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
639 aa  662    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000179764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1228  threonyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 
635 aa  647    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000338672  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1779  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
635 aa  659    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420901  normal  0.799245 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
635 aa  654    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1010  threonyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
640 aa  640    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 
640 aa  657    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1990  threonyl-tRNA synthetase  50.46 
 
 
636 aa  668    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0457996  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
635 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1140  threonyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
644 aa  677    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000099925  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1418  threonyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
638 aa  661    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102997  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
635 aa  651    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1411  threonyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 
645 aa  667    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000074774  normal  0.343495 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2639  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
644 aa  636    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.3159  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0797  threonyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
652 aa  641    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1452  threonyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
635 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0192845  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1759  threonyl-tRNA synthetase  49.85 
 
 
633 aa  652    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991077  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  49 
 
 
635 aa  648    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0566  threonyl-tRNA synthetase  53.78 
 
 
583 aa  662    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1399  threonyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
635 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00532167  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1450  threonyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 
643 aa  691    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
635 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0912  threonyl-tRNA synthetase  53.31 
 
 
638 aa  712    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2401  threonyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 
634 aa  638    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.162517  normal  0.284009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2614  threonyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
644 aa  683    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4736  threonyl-tRNA synthetase  100 
 
 
659 aa  1359    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2243  threonyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
644 aa  683    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00594301  hitchhiker  0.00373508 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
635 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
635 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
635 aa  654    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
635 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
635 aa  654    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1384  threonyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 
635 aa  640    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000717334  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
635 aa  648    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1869  threonyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 
646 aa  648    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
635 aa  653    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0363  threonyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
648 aa  672    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0255987  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2308  threonyl-tRNA synthetase  50.94 
 
 
636 aa  661    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2661  threonyl-tRNA synthetase  48.22 
 
 
644 aa  652    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000386283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1558  threonyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
635 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
635 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1612  threonyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 
635 aa  680    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000178172  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0108  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 
643 aa  672    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  49 
 
 
635 aa  639    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
635 aa  632  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0424  threonyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
644 aa  632  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000699319  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4472  threonyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
645 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.419718  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2057  threonyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 
634 aa  630  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000136416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4307  threonyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
645 aa  629  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00228432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0552  threonyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
645 aa  629  1e-179  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000171694  unclonable  1.90469e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4318  threonyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
645 aa  629  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0311311  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4820  threonyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
645 aa  629  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00851939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4691  threonyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
645 aa  629  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.88699e-59 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0707  threonyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 
644 aa  629  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00542671  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4685  threonyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
645 aa  628  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00204863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4707  threonyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
645 aa  628  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000334194  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3262  threonyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 
643 aa  627  1e-178  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00002753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4407  threonyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 
645 aa  628  1e-178  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00383919  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  47.77 
 
 
638 aa  627  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1977  threonyl-tRNA synthetase  48 
 
 
635 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 
635 aa  626  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1372  threonyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
635 aa  625  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000383369  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 
635 aa  627  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1647  threonyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
635 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0710025 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1669  threonyl-tRNA synthetase  49 
 
 
637 aa  625  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000137846  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4701  threonyl-tRNA synthetase  47 
 
 
645 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000566692  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  47.69 
 
 
636 aa  622  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
635 aa  623  1e-177  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 
635 aa  620  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
637 aa  619  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0043  threonyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
649 aa  621  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1300  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  47.47 
 
 
639 aa  619  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5204  threonyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 
688 aa  618  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.144339 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2219  threonyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 
647 aa  619  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0771332 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0187  threonyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
640 aa  616  1e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00194489  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
637 aa  618  1e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0189  threonyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
640 aa  616  1e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
638 aa  615  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 
641 aa  615  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
635 aa  618  1e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
644 aa  616  1e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3742  threonyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
646 aa  612  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.190527  hitchhiker  0.00137888 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0516  threonyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
637 aa  613  9.999999999999999e-175  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1824  threonyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 
636 aa  612  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000392835  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3886  threonyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
687 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2168  threonyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
661 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.762302  normal  0.0294607 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0725  threonyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 
638 aa  612  9.999999999999999e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4616  threonyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 
643 aa  613  9.999999999999999e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213357 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3025  threonyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 
638 aa  614  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1327  threonyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 
636 aa  610  1e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0393085  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2805  threonyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
633 aa  610  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0121  threonyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 
596 aa  609  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
669 aa  610  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1025  threonyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 
638 aa  608  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.572663  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2997  threonyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
644 aa  610  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>