More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3333 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  100 
 
 		 480 aa  963    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5065  amino acid permease-associated region  41.88 
 
 		 457 aa  354  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0442814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2442  amino acid permease-associated region  41.05 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  26.21 
 
 		 522 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  26.58 
 
 		 469 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  28.79 
 
 		 452 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  28.11 
 
 		 485 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  27.44 
 
 		 461 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1252  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 484 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  26.39 
 
 		 499 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  24.63 
 
 		 474 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  25.91 
 
 		 491 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  27.53 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  27.2 
 
 		 464 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4660  amino acid permease-associated region  27.18 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.87278  normal  0.151026 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 		 453 aa  126  7e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  24.49 
 
 		 489 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  27.23 
 
 		 473 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1785  amino acid permease-associated region  25.87 
 
 		 491 aa  124  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 		 486 aa  123  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  23.44 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  28.87 
 
 		 489 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  25.74 
 
 		 486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  24.43 
 
 		 501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 		 463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  31.18 
 
 		 495 aa  120  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  25.71 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  26.23 
 
 		 473 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  26.01 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  26.01 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 		 518 aa  116  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  26.48 
 
 		 764 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  24.88 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  23.81 
 
 		 443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 466 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  24.48 
 
 		 495 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6226  amino acid permease-associated region  24.12 
 
 		 490 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21440  amino acid transporter  25.55 
 
 		 512 aa  114  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.250254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  24.93 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  23.84 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  23.85 
 
 		 483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1840  amino acid transporter  24.55 
 
 		 466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  24.16 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 		 500 aa  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3685  amino acid permease  24.05 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  24.81 
 
 		 481 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  22.51 
 
 		 439 aa  110  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  24.62 
 
 		 467 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  24.84 
 
 		 467 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  24.84 
 
 		 467 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  23.75 
 
 		 456 aa  110  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  24.62 
 
 		 467 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  24.62 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  26.47 
 
 		 478 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 		 444 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  24.62 
 
 		 467 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  24.62 
 
 		 467 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  25.94 
 
 		 506 aa  110  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  25.84 
 
 		 452 aa  109  9.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  25.51 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  26 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  23.6 
 
 		 471 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  24.37 
 
 		 467 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  24.11 
 
 		 474 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  24.17 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 		 436 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  26.91 
 
 		 437 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  24.17 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  24.17 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  23.32 
 
 		 471 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  25.99 
 
 		 437 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  24.17 
 
 		 471 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  24.14 
 
 		 467 aa  107  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  25.75 
 
 		 438 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  25.75 
 
 		 438 aa  106  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  25.75 
 
 		 437 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  25.88 
 
 		 438 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  25.38 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  25.75 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  23.4 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  25.66 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  24.64 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2269  amino acid permease-associated region  26.26 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.841553  normal  0.0284439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  24.29 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  25.66 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  23.52 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  24.64 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  23.4 
 
 		 471 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  23.69 
 
 		 471 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  23.19 
 
 		 471 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  23.04 
 
 		 471 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1808  amino acid transporter  24.54 
 
 		 465 aa  104  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000076298  hitchhiker  0.0000000000409798 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0176  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  23.79 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0718  amino acid permease family protein  26.18 
 
 		 473 aa  103  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.902571  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  25.73 
 
 		 476 aa  103  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  23.04 
 
 		 471 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  23.04 
 
 		 471 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>