More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2697 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02583  DNA mismatch repair protein  42.08 
 
 		 853 aa  659    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.858461  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0955  DNA mismatch repair protein MutS  42.08 
 
 		 853 aa  659    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 		 859 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 		 858 aa  680    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  46.95 
 
 		 871 aa  763    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  40.24 
 
 		 891 aa  654    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  46.27 
 
 		 882 aa  674    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  40.5 
 
 		 873 aa  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  43.53 
 
 		 854 aa  655    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  41.83 
 
 		 856 aa  666    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  39.54 
 
 		 872 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  41.64 
 
 		 871 aa  674    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  40.99 
 
 		 872 aa  659    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2860  DNA mismatch repair protein MutS  41.98 
 
 		 853 aa  659    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  41.79 
 
 		 871 aa  664    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3431  DNA mismatch repair protein MutS  41.83 
 
 		 856 aa  648    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 		 855 aa  641    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  41.02 
 
 		 878 aa  664    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  40.94 
 
 		 890 aa  637    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  41.69 
 
 		 875 aa  673    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0833  DNA mismatch repair protein MutS  41.54 
 
 		 851 aa  660    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  40.82 
 
 		 867 aa  731    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 		 928 aa  642    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  41.7 
 
 		 859 aa  646    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3424  DNA mismatch repair protein MutS  41.07 
 
 		 851 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  41.49 
 
 		 856 aa  657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  41.68 
 
 		 859 aa  663    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3734  DNA mismatch repair protein MutS  41.25 
 
 		 883 aa  659    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648477  decreased coverage  0.000000000582755 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  44.06 
 
 		 900 aa  731    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  44.57 
 
 		 932 aa  747    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3030  DNA mismatch repair protein MutS  41.98 
 
 		 860 aa  659    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  44.59 
 
 		 854 aa  659    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  44.13 
 
 		 881 aa  701    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  43.44 
 
 		 863 aa  676    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  41.52 
 
 		 860 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  43.47 
 
 		 858 aa  673    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  44.73 
 
 		 870 aa  754    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 		 895 aa  644    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 		 863 aa  718    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  41.83 
 
 		 873 aa  665    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  44.03 
 
 		 868 aa  746    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  47.13 
 
 		 872 aa  772    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  42.43 
 
 		 869 aa  741    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  41.93 
 
 		 871 aa  662    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 		 872 aa  669    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1045  DNA mismatch repair protein MutS  43.33 
 
 		 854 aa  668    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  42.72 
 
 		 882 aa  635    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  40.15 
 
 		 881 aa  669    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2871  DNA mismatch repair protein MutS  42.08 
 
 		 853 aa  659    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  42.89 
 
 		 863 aa  655    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  41.6 
 
 		 856 aa  665    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  47.1 
 
 		 882 aa  699    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  40.32 
 
 		 855 aa  675    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0979  DNA mismatch repair protein MutS  42.08 
 
 		 853 aa  659    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.462533 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  44.21 
 
 		 823 aa  685    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  39.54 
 
 		 872 aa  661    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3292  DNA mismatch repair protein MutS  41.27 
 
 		 851 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  41.19 
 
 		 855 aa  648    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  42.77 
 
 		 887 aa  658    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  43.21 
 
 		 872 aa  687    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  41.16 
 
 		 884 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  41.16 
 
 		 884 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3211  DNA mismatch repair protein MutS  40.91 
 
 		 853 aa  651    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.864311  normal  0.594165 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  41.26 
 
 		 855 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  40.11 
 
 		 862 aa  655    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  43.6 
 
 		 887 aa  746    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  40.8 
 
 		 858 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  43.1 
 
 		 859 aa  662    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  41.83 
 
 		 856 aa  665    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3114  DNA mismatch repair protein MutS  42.24 
 
 		 855 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090493 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0956  DNA mismatch repair protein MutS  41.27 
 
 		 851 aa  644    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 882 aa  1802    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  44.67 
 
 		 870 aa  742    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  44.93 
 
 		 882 aa  692    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  40.25 
 
 		 862 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  41.57 
 
 		 872 aa  674    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3263  DNA mismatch repair protein MutS  40.51 
 
 		 889 aa  637    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3098  DNA mismatch repair protein MutS  42.24 
 
 		 855 aa  675    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  41.61 
 
 		 856 aa  691    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 		 910 aa  692    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  40.11 
 
 		 910 aa  688    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  40.4 
 
 		 856 aa  662    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  42.34 
 
 		 901 aa  641    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  42.06 
 
 		 861 aa  671    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  41.6 
 
 		 861 aa  667    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  43.76 
 
 		 878 aa  680    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  40.69 
 
 		 861 aa  644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  45.3 
 
 		 859 aa  744    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  42.44 
 
 		 874 aa  692    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  46.84 
 
 		 872 aa  756    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  41.19 
 
 		 855 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1299  DNA mismatch repair protein MutS  41.1 
 
 		 859 aa  654    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.537227  hitchhiker  0.00000000408163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  41.04 
 
 		 857 aa  636    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  44.96 
 
 		 872 aa  743    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3143  DNA mismatch repair protein MutS  41.96 
 
 		 853 aa  656    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 		 870 aa  744    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  43.69 
 
 		 857 aa  686    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  45.5 
 
 		 889 aa  717    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 		 868 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  41.94 
 
 		 861 aa  672    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>