48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1593 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1593  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5437  hypothetical protein  46.15 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.501494 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1169  hypothetical protein  46.15 
 
 
150 aa  118  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.200883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1124  hypothetical protein  42.11 
 
 
156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.221098  normal  0.514803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1113  hypothetical protein  42.28 
 
 
317 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1193  hypothetical protein  42.28 
 
 
317 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5865  hypothetical protein  44.44 
 
 
321 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4396  hypothetical protein  38.82 
 
 
158 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.479325  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1577  hypothetical protein  37.41 
 
 
153 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2293  hypothetical protein  39.46 
 
 
320 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4357  hypothetical protein  42.67 
 
 
155 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2262  hypothetical protein  38.1 
 
 
154 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal  0.0310926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1304  hypothetical protein  37.09 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.448465  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1446  hypothetical protein  46.67 
 
 
330 aa  98.2  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0570  hypothetical protein  39.01 
 
 
161 aa  98.2  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1001  hypothetical protein  37.06 
 
 
154 aa  97.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36530  hypothetical protein  38.3 
 
 
150 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00120253  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3135  hypothetical protein  38.3 
 
 
150 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222956  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0797  hypothetical protein  37.5 
 
 
179 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0820  hypothetical protein  37.5 
 
 
158 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.169744 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0831  hypothetical protein  37.5 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.521275  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5302  hypothetical protein  38.57 
 
 
150 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163208  normal  0.0551746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1353  hypothetical protein  38.19 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2897  hypothetical protein  36.36 
 
 
152 aa  82  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0169773 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1746  hypothetical protein  36.76 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07210  hypothetical protein  33.09 
 
 
158 aa  76.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00225  hypothetical protein  30.41 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2621  hypothetical protein  38.94 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.652955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1839  hypothetical protein  36.18 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.756028  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3966  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  30.14 
 
 
151 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  0.194961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3187  hypothetical protein  29.8 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455411  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1205  hypothetical protein  26.95 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.512169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0760  Protein of unknown function DUF2383  35.24 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.462088  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2659  hypothetical protein  28.57 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.295349  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0627  hypothetical protein  29.31 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2163  hypothetical protein  29.46 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.096246  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04630  hypothetical protein  25.37 
 
 
166 aa  60.8  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1122  hypothetical protein  28.38 
 
 
160 aa  60.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234261  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0359  hypothetical protein  28.86 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401814  normal  0.430905 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0169  hypothetical protein  27.34 
 
 
150 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6235  Protein of unknown function DUF2383  29.06 
 
 
151 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.888626  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2525  hypothetical protein  26.88 
 
 
187 aa  51.6  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778896  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1244  hypothetical protein  29.55 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0835823  unclonable  0.0000000177159 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4091  hypothetical protein  22.38 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2698  hypothetical protein  31.76 
 
 
152 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.651066  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3555  hypothetical protein  23.57 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4024  hypothetical protein  28.7 
 
 
150 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01766  hypothetical protein  25.24 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.756616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>