More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1205 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1205  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 441 aa  908    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 414 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 415 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 414 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 413 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 423 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 420 aa  369  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 421 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 429 aa  364  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 424 aa  363  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 424 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 424 aa  363  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 424 aa  363  4e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 424 aa  363  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 424 aa  363  4e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  45.35 
 
 		 424 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 424 aa  363  4e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 424 aa  363  4e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 417 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 		 423 aa  360  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 426 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 424 aa  360  4e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 424 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 424 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 420 aa  356  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 420 aa  356  3.9999999999999996e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 424 aa  356  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 436 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 413 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 416 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 416 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 422 aa  353  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 415 aa  353  5e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 421 aa  352  7e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 421 aa  351  2e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 420 aa  350  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 424 aa  350  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 424 aa  350  3e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0009  histidyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 416 aa  349  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0511453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 423 aa  349  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 419 aa  349  7e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 422 aa  348  7e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 424 aa  349  7e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  44.55 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 422 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 429 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2037  histidyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 423 aa  346  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6102  Histidine--tRNA ligase  46.14 
 
 		 421 aa  346  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 429 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 423 aa  346  6e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 423 aa  345  7e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 423 aa  345  7e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 420 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 419 aa  344  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 423 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 424 aa  343  5e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 425 aa  341  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 424 aa  341  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 464 aa  341  2e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 400 aa  341  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 424 aa  340  4e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 424 aa  339  7e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5012  histidyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0324448 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 423 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 425 aa  336  5e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 		 433 aa  335  7e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 425 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 420 aa  334  2e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 418 aa  334  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 423 aa  333  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>