136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2037 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  100 
 
 
254 aa  517  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  83.61 
 
 
240 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  54.62 
 
 
264 aa  265  4e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  53.04 
 
 
250 aa  258  9e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  48.5 
 
 
250 aa  198  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  46.12 
 
 
245 aa  195  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.44 
 
 
248 aa  193  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  48.71 
 
 
270 aa  192  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.88 
 
 
238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  41.18 
 
 
243 aa  189  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  43.44 
 
 
248 aa  189  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  41.53 
 
 
243 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  41.53 
 
 
243 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  45.79 
 
 
241 aa  185  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.79 
 
 
243 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  43.88 
 
 
246 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.39 
 
 
254 aa  179  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.74 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.69 
 
 
264 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.69 
 
 
264 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  40.59 
 
 
243 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.16 
 
 
248 aa  168  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  41.18 
 
 
272 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.95 
 
 
237 aa  166  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  44.5 
 
 
241 aa  166  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  44 
 
 
270 aa  166  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.57 
 
 
251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.5 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.86 
 
 
255 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  38.14 
 
 
241 aa  158  7e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  41.08 
 
 
242 aa  153  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  36.67 
 
 
243 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  36.67 
 
 
243 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  40.17 
 
 
744 aa  151  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  38.83 
 
 
231 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  35.68 
 
 
262 aa  149  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  38.5 
 
 
227 aa  148  7e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  38.94 
 
 
238 aa  148  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  36.71 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  36.71 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  43.62 
 
 
249 aa  146  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  36.71 
 
 
238 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  37.08 
 
 
238 aa  145  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  40 
 
 
262 aa  144  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  38.5 
 
 
235 aa  142  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  34.23 
 
 
244 aa  141  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  35.87 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  35.92 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  34.39 
 
 
243 aa  139  6e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.88 
 
 
218 aa  136  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.02 
 
 
240 aa  136  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.85 
 
 
235 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  35.98 
 
 
238 aa  131  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  35.51 
 
 
250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.64 
 
 
245 aa  129  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  34.19 
 
 
235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  37.09 
 
 
272 aa  125  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.01 
 
 
236 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  31.98 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  35.58 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  35.1 
 
 
240 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  32.57 
 
 
247 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  33.96 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  36.36 
 
 
235 aa  102  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1326  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  29.6 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000536393  hitchhiker  0.000591695 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  31.82 
 
 
512 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  30.54 
 
 
500 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  30.54 
 
 
500 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  30.05 
 
 
488 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  29.35 
 
 
484 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  31.17 
 
 
481 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0238  cobyric acid synthase  31.21 
 
 
518 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.267463  normal  0.284689 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  31.17 
 
 
481 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  26.44 
 
 
492 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  31.17 
 
 
512 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  29.41 
 
 
489 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  26.57 
 
 
492 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  35.34 
 
 
787 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  29.61 
 
 
485 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2504  cobyric acid synthase  31.49 
 
 
520 aa  52.8  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.177282  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  30.91 
 
 
506 aa  52  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  30.3 
 
 
483 aa  52  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  29.29 
 
 
534 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3285  cobyric acid synthase  30.2 
 
 
525 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  28.25 
 
 
465 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  26.24 
 
 
477 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  28.1 
 
 
507 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  31.75 
 
 
496 aa  49.3  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  29.38 
 
 
481 aa  48.9  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  30.49 
 
 
484 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  30 
 
 
486 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  29.44 
 
 
492 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  28.57 
 
 
488 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  29.84 
 
 
491 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  32.08 
 
 
490 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  29.03 
 
 
772 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  30.95 
 
 
776 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  25.2 
 
 
480 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  33.33 
 
 
494 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2874  cobyric acid synthase CobQ  33.33 
 
 
465 aa  45.8  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>