103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0981 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0981  ferredoxin  100 
 
 
273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000024477  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4094  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  52.56 
 
 
264 aa  256  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.405546 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2666  ferredoxin  52.76 
 
 
239 aa  246  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1250  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  53.24 
 
 
227 aa  221  9e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0849107  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1745  ferredoxin  38.57 
 
 
249 aa  182  7e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0640464 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4302  ferredoxin  32.32 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0232293  decreased coverage  0.00591576 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2912  ferredoxin  29.33 
 
 
224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0453535 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4590  ferredoxin:4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.82 
 
 
212 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3934  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.83 
 
 
220 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0320  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  28.38 
 
 
494 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1592  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  27.63 
 
 
494 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.220062  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0522  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  26.75 
 
 
494 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  24.89 
 
 
494 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.573606  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1571  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.12 
 
 
438 aa  52.8  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0387  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.9 
 
 
435 aa  52  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.74 
 
 
216 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614273  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2017  electron transport complex protein RnfC  35.94 
 
 
558 aa  51.2  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0680  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  33.73 
 
 
435 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2536  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  30.26 
 
 
446 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.892294  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0704  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  33.73 
 
 
435 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0936  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  39.06 
 
 
609 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.787123  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1161  electron transport complex protein RnfC  33.33 
 
 
570 aa  49.7  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.51 
 
 
983 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.51 
 
 
983 aa  48.9  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.51 
 
 
983 aa  48.9  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0079  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  32.43 
 
 
443 aa  47.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000481582  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.55 
 
 
983 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2967  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  32.05 
 
 
890 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.390488  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1819  electron transport complex protein RnfC  40 
 
 
673 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000614228 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02966  electron transport complex protein RnfC  37.5 
 
 
912 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0062  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35 
 
 
354 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02731  electron transport complex protein RnfC  36.92 
 
 
852 aa  47  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.618008  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.85 
 
 
427 aa  46.6  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395761  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2174  electron transport complex protein RnfC  27.97 
 
 
846 aa  46.6  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.234957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2430  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  34.78 
 
 
439 aa  46.2  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216673  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0717  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  21.03 
 
 
538 aa  46.6  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.942612  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  21.89 
 
 
983 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  21.89 
 
 
983 aa  45.8  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0690  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  34.15 
 
 
787 aa  45.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.676741  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2063  electron transport complex protein RnfC  32.39 
 
 
885 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00525621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2110  electron transport complex protein RnfC  32.39 
 
 
888 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.524779  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1537  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  32.67 
 
 
375 aa  45.4  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0761099  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2341  electron transport complex protein RnfC  36.36 
 
 
772 aa  45.4  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288695  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2275  electron transport complex protein RnfC  32.39 
 
 
876 aa  45.8  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169634  normal  0.804532 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01599  electron transport complex protein RnfC  36.36 
 
 
740 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0105357  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2012  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  36.36 
 
 
740 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000275301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1494  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  36.07 
 
 
503 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0263  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC  35.14 
 
 
437 aa  45.4  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4547  electron transport complex protein RnfC  32.39 
 
 
884 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2261  electron transport complex protein RnfC  32.39 
 
 
884 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0443736  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1705  electron transport complex protein RnfC  36.36 
 
 
740 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0365167  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1837  electron transport complex protein RnfC  36.36 
 
 
740 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0944307  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0813  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  32.67 
 
 
375 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.38 
 
 
983 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2000  electron transport complex protein RnfC  36.36 
 
 
740 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000227688  normal  0.287278 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1570  electron transport complex protein RnfC  36.36 
 
 
676 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133646  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1818  electron transport complex protein RnfC  36.36 
 
 
708 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.243946  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1567  electron transport complex protein RnfC  36.36 
 
 
735 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0379557 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1627  electron transport complex protein RnfC  36.36 
 
 
735 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0777449  normal  0.304577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1555  electron transport complex protein RnfC  36.36 
 
 
732 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.555385  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1717  electron transport complex protein RnfC  36.36 
 
 
735 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1885  electron transport complex protein RnfC  36.36 
 
 
704 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3234  electron transport complex protein RnfC  38.89 
 
 
573 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002947  electron transport complex protein RnfC  36.92 
 
 
916 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.703595  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01589  hypothetical protein  36.36 
 
 
694 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00945839  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2023  electron transport complex protein RnfC  36.36 
 
 
747 aa  45.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  27.83 
 
 
188 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1426  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.77 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1402  electron transport complex protein RnfC  35.38 
 
 
944 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.860812 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1547  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  26.83 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2239  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.18 
 
 
703 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000974734 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1091  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  36.92 
 
 
437 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2628  electron transport complex protein RnfC  31.31 
 
 
532 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1327  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.99 
 
 
439 aa  44.3  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000291101  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0699  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.88 
 
 
442 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2323  electron transport complex protein RnfC  35.94 
 
 
737 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1785  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30 
 
 
567 aa  44.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1832  electron transport complex protein RnfC  33.33 
 
 
880 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0828396 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  22.22 
 
 
582 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  26.44 
 
 
193 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1918  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.18 
 
 
673 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2156  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.18 
 
 
673 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261031  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2401  electron transport complex protein RnfC  31.65 
 
 
745 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1543  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  32.88 
 
 
981 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0195747 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1896  electron transport complex protein RnfC  34.72 
 
 
698 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.813056  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2042  electron transport complex protein RnfC  29.63 
 
 
842 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875859  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2252  electron transport complex protein RnfC  34.72 
 
 
659 aa  43.5  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00637467  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2008  electron transport complex protein RnfC  34.72 
 
 
698 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1870  electron transport complex protein RnfC  37.04 
 
 
716 aa  43.5  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00517809  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2502  iron-containing hydrogenase, Hyd gamma  33.33 
 
 
598 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  22.58 
 
 
957 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2551  iron-sulfur cluster-binding protein  27.27 
 
 
239 aa  43.1  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802978  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50960  Electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  34.85 
 
 
496 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.228247  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0434  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  33.93 
 
 
806 aa  42.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1034  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  35.94 
 
 
704 aa  42.7  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.321702  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2197  electron transport complex protein RnfC  30.77 
 
 
788 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1638  electron transport complex protein RnfC  30.88 
 
 
776 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0188  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.77 
 
 
410 aa  42.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1663  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  26.87 
 
 
436 aa  42.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0959  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.34 
 
 
453 aa  42.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.848293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>