58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_4094 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_4094  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 264 aa  546  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.405546 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2666  ferredoxin  50.68 
 
 		 239 aa  258  5.0000000000000005e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0981  ferredoxin  52.56 
 
 		 273 aa  256  3e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000024477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1250  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.41 
 
 		 227 aa  246  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0849107  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1745  ferredoxin  39.68 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2912  ferredoxin  30.88 
 
 		 224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0453535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4302  ferredoxin  28.43 
 
 		 212 aa  108  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0232293  decreased coverage  0.00591576 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4590  ferredoxin:4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  28.79 
 
 		 212 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3934  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.78 
 
 		 220 aa  92.8  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1494  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  43.48 
 
 		 503 aa  59.3  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0320  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25.78 
 
 		 494 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1592  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25.33 
 
 		 494 aa  52.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.220062  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2967  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.95 
 
 		 890 aa  48.5  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.390488  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1571  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  33.33 
 
 		 438 aa  47.4  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614273  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2275  electron transport complex protein RnfC  29.23 
 
 		 876 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169634  normal  0.804532 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2991  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  37.29 
 
 		 481 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2063  electron transport complex protein RnfC  29.23 
 
 		 885 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00525621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2110  electron transport complex protein RnfC  29.23 
 
 		 888 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.524779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3194  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  35.59 
 
 		 519 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0522  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  24.44 
 
 		 494 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2822  electron transport complex, C subunit  36.21 
 
 		 495 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2261  electron transport complex protein RnfC  30 
 
 		 884 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0443736  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4547  electron transport complex protein RnfC  30 
 
 		 884 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  22.75 
 
 		 494 aa  46.6  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.573606  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3933  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  36.36 
 
 		 517 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00505107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3194  4Fe-4S ferredoxin, RnfC  36.36 
 
 		 517 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2156  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.83 
 
 		 673 aa  45.8  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261031  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0387  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  33.33 
 
 		 435 aa  45.4  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0936  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.77 
 
 		 609 aa  45.4  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.787123  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2017  electron transport complex protein RnfC  35 
 
 		 558 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0610  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.17 
 
 		 440 aa  44.7  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0321334  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50960  Electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  23.92 
 
 		 496 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.228247  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2355  electron transport complex protein RnfC  29.27 
 
 		 825 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0717  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  24.43 
 
 		 538 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.942612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2323  electron transport complex protein RnfC  39.29 
 
 		 737 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2023  electron transport complex protein RnfC  39.29 
 
 		 747 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 427 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395761  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2042  electron transport complex protein RnfC  27.59 
 
 		 842 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1074  ferredoxin-(2Fe-2S)-binding protein  34.72 
 
 		 120 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  29.75 
 
 		 469 aa  43.1  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  24.47 
 
 		 202 aa  43.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1918  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  39.29 
 
 		 673 aa  43.1  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1848  electron transport complex protein RnfC  30 
 
 		 793 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00264282  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  26.32 
 
 		 210 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1091  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.86 
 
 		 437 aa  42.7  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.566886  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  26.32 
 
 		 215 aa  42.4  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  25.26 
 
 		 208 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  25.26 
 
 		 208 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1673  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  35.48 
 
 		 778 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  25.26 
 
 		 208 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2528  NADH dehydrogenase subunit I  24.47 
 
 		 200 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  25.26 
 
 		 208 aa  42.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0311  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  25.2 
 
 		 779 aa  42  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.435383  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1373  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  29.27 
 
 		 786 aa  42  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.619711  normal  0.51907 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  25.26 
 
 		 215 aa  42  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1909  electron transport complex protein RnfC  27.87 
 
 		 799 aa  42  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.567258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1402  electron transport complex protein RnfC  32.14 
 
 		 944 aa  42  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.860812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>