49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0959 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0959  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 
453 aa  937    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.848293  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0828  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  60.57 
 
 
836 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0955  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  59.91 
 
 
463 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157749  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2619  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  33.62 
 
 
468 aa  248  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.912572  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0961  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.89 
 
 
407 aa  229  1e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3880  hypothetical protein  36.41 
 
 
459 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.712619  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2892  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  35.81 
 
 
537 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0139  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  32.28 
 
 
428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.668002  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0214  iron-sulfur cluster-binding protein/coenzyme F420-reducing hydrogenase, beta subunit, putative  33.05 
 
 
428 aa  163  6e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0585  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  29.08 
 
 
395 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00081136  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4135  hypothetical protein  27.3 
 
 
440 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4481  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  26.22 
 
 
418 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0174  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  29.28 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.318509  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0783  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  25.66 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00366682  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0662  coenzyme F420 hydrogenase beta subunit  25.78 
 
 
344 aa  67  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0140  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  21.01 
 
 
867 aa  66.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  7.0838e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0255  F420H2 dehydrogenase subunit F  21.56 
 
 
346 aa  59.7  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2944  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  24.06 
 
 
409 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0331  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.48 
 
 
339 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0422  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  25.14 
 
 
355 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.664623 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2707  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  26.98 
 
 
341 aa  53.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.889848  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1303  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.65 
 
 
357 aa  52.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.808254  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1150  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.38 
 
 
364 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2371  F420H2 dehydrogenase subunit F  20.7 
 
 
343 aa  51.6  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0778  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25 
 
 
618 aa  50.8  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.542223  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1693  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  26.67 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.884047  normal  0.69888 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1095  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.86 
 
 
67 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.121461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0964  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  25.97 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1241  ferredoxin family protein  35.48 
 
 
96 aa  48.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.251684  normal  0.0451259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0881  coenzyme F420 hydrogenase, beta subunit  24.47 
 
 
387 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  42.59 
 
 
598 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0866  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.68 
 
 
359 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.161905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0545  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.62 
 
 
697 aa  47.4  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1595  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  21.74 
 
 
359 aa  47.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.502541  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2261  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like protein  21.26 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3268  putative coenzyme F420 hydrogenase  25.18 
 
 
409 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.96965 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1081  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.24 
 
 
359 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1318  NADH dehydrogenase (quinone)  42.31 
 
 
626 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1368  NADH dehydrogenase (quinone)  42.31 
 
 
626 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2666  ferredoxin  32.5 
 
 
239 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1440  ferridoxin  40.35 
 
 
140 aa  44.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.760921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1351  iron-sulfur cluster-binding protein  43.14 
 
 
322 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06770  3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase (ferredoxin), delta subunit  47.06 
 
 
70 aa  43.5  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0375  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.59 
 
 
91 aa  43.5  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.25 
 
 
368 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1291  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  41.38 
 
 
152 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2713  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.4 
 
 
656 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.875426 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1544  ferredoxin  38.6 
 
 
73 aa  43.1  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0477  coenzyme F420 hydrogenase  36.84 
 
 
252 aa  43.1  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.741766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>