143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1250 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1250  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 227 aa  470  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0849107  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2666  ferredoxin  57.08 
 
 		 239 aa  293  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4094  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  55.66 
 
 		 264 aa  275  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.405546 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0981  ferredoxin  53.24 
 
 		 273 aa  249  2e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000024477  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1745  ferredoxin  43.81 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2912  ferredoxin  34.56 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0453535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4302  ferredoxin  33.17 
 
 		 212 aa  122  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0232293  decreased coverage  0.00591576 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4590  ferredoxin:4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.22 
 
 		 212 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3934  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.66 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0320  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25.64 
 
 		 494 aa  55.5  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1592  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25.47 
 
 		 494 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.220062  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0065  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.43 
 
 		 448 aa  52.4  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1571  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  26.21 
 
 		 438 aa  52.8  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1494  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  43.75 
 
 		 503 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0387  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  25 
 
 		 435 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0522  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  24.62 
 
 		 494 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  26.37 
 
 		 494 aa  50.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.573606  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0936  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  26.34 
 
 		 609 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.787123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2023  electron transport complex protein RnfC  28.15 
 
 		 747 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002947  electron transport complex protein RnfC  30.53 
 
 		 916 aa  48.9  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.703595  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3194  electron transport complex, RnfABCDGE type, D subunit  30 
 
 		 519 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  24.64 
 
 		 582 aa  48.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1543  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  37.29 
 
 		 981 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2063  electron transport complex protein RnfC  27.27 
 
 		 885 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00525621  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.73 
 
 		 427 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5093  NADH dehydrogenase subunit I  36.36 
 
 		 139 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5420  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 		 139 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5145  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 		 139 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4977  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 		 139 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4995  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 		 139 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5416  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 		 139 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5537  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 		 139 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2401  electron transport complex protein RnfC  37.5 
 
 		 745 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2275  electron transport complex protein RnfC  28.46 
 
 		 876 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169634  normal  0.804532 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2174  electron transport complex protein RnfC  26.88 
 
 		 846 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.234957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5534  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 		 139 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0249659 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5386  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 		 139 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1901e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5471  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 		 139 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2323  electron transport complex protein RnfC  26.94 
 
 		 737 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4547  electron transport complex protein RnfC  28.46 
 
 		 884 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1918  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.71 
 
 		 673 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2261  electron transport complex protein RnfC  28.46 
 
 		 884 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0443736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2110  electron transport complex protein RnfC  28.46 
 
 		 888 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.524779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0257  NADH-plastoquinone oxidoreductase subunit I  34.92 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0227  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  39.22 
 
 		 778 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2536  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit A  37.04 
 
 		 446 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.892294  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1870  electron transport complex protein RnfC  36.36 
 
 		 716 aa  46.2  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00517809  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  36.07 
 
 		 778 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.471946  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0311  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  37.25 
 
 		 779 aa  46.6  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.435383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3814  NADH dehydrogenase subunit I  35.35 
 
 		 139 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2822  electron transport complex, C subunit  30.21 
 
 		 495 aa  46.2  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1638  electron transport complex protein RnfC  39.71 
 
 		 776 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1673  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  36.07 
 
 		 778 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0079  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  24 
 
 		 443 aa  45.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000481582  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3408  NADH dehydrogenase subunit I  37.04 
 
 		 139 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2042  electron transport complex protein RnfC  27.62 
 
 		 842 aa  45.4  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0661  molybdopterin oxidoreductase  25.25 
 
 		 808 aa  45.4  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0673  molybdopterin oxidoreductase  23.65 
 
 		 822 aa  45.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01358e-20 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2197  electron transport complex protein RnfC  29.36 
 
 		 788 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1161  electron transport complex protein RnfC  35.71 
 
 		 570 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0281  NADH dehydrogenase subunit I  33.33 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0062  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.43 
 
 		 354 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2170  electron transport complex protein RnfC  27.27 
 
 		 788 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0332538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2430  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.98 
 
 		 439 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0955  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.45 
 
 		 463 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.157749  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2156  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.2 
 
 		 673 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261031  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1848  electron transport complex protein RnfC  34.38 
 
 		 793 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00264282  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1402  electron transport complex protein RnfC  37.08 
 
 		 944 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.860812 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0680  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  22.54 
 
 		 435 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02966  electron transport complex protein RnfC  40.68 
 
 		 912 aa  44.7  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3296  NADH dehydrogenase subunit I  38.27 
 
 		 139 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0384  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  24.16 
 
 		 1175 aa  44.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0704  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  22.54 
 
 		 435 aa  44.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2510  electron transport complex protein RnfC  27.27 
 
 		 790 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2991  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  38.89 
 
 		 481 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2715  NADH dehydrogenase subunit I  37.7 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1173  electron transport complex protein RnfC  39.06 
 
 		 515 aa  44.3  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3194  4Fe-4S ferredoxin, RnfC  33.33 
 
 		 517 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  35.85 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2411  NADH dehydrogenase subunit I  32.79 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1781  hydrogenase, Fe-only  26.21 
 
 		 578 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  36.07 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0690  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  31.52 
 
 		 787 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.676741  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2067  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.41 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0858  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  34.48 
 
 		 802 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000764937  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2066  electron transport complex protein RnfC  34.38 
 
 		 809 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00275367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1909  electron transport complex protein RnfC  34.38 
 
 		 799 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.567258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.36 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000614273  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  36.07 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  36.07 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  36.07 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2068  electron transport complex protein RnfC  28.3 
 
 		 870 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2497  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.59 
 
 		 317 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01761  NADH dehydrogenase subunit I  36.07 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2017  electron transport complex protein RnfC  28.87 
 
 		 558 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18920  electron transport complex protein RnfC  40 
 
 		 774 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000329645  normal  0.0619935 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  36.07 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02731  electron transport complex protein RnfC  37.04 
 
 		 852 aa  43.5  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.618008  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1428  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35 
 
 		 352 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0805152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>