31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3934 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3934  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  100 
 
 		 220 aa  446  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4590  ferredoxin:4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  60.77 
 
 		 212 aa  270  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4302  ferredoxin  60.77 
 
 		 212 aa  263  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0232293  decreased coverage  0.00591576 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0981  ferredoxin  32.83 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000024477  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2666  ferredoxin  29.8 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4094  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.78 
 
 		 264 aa  92.8  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.405546 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1745  ferredoxin  28.42 
 
 		 249 aa  89.4  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2912  ferredoxin  27.32 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0453535 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1250  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0849107  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0858  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  33.93 
 
 		 802 aa  47.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000764937  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1373  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  37.7 
 
 		 786 aa  47  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.619711  normal  0.51907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.18 
 
 		 960 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.8 
 
 		 984 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  26.8 
 
 		 1150 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.8 
 
 		 984 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.8 
 
 		 984 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.8 
 
 		 984 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  27.8 
 
 		 984 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.8 
 
 		 984 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.7 
 
 		 960 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0475  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  34.55 
 
 		 768 aa  43.1  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.908557  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0434  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  32.08 
 
 		 806 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  43.48 
 
 		 539 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.01 
 
 		 952 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0690  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  31.88 
 
 		 787 aa  42.7  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.676741  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.7 
 
 		 960 aa  42  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0204  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  32.08 
 
 		 806 aa  42.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00731411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2017  electron transport complex protein RnfC  39.34 
 
 		 558 aa  42  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3004  ferredoxin  24.52 
 
 		 493 aa  41.6  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.79 
 
 		 1000 aa  41.6  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  29.48 
 
 		 977 aa  41.6  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>