53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0434 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0858  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  62.53 
 
 		 802 aa  1079    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000764937  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1174  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  42.18 
 
 		 786 aa  639    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0311  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  46.33 
 
 		 779 aa  697    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.435383  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0227  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  46.32 
 
 		 778 aa  694    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0805  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  47.14 
 
 		 778 aa  699    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.471946  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1373  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  44.42 
 
 		 786 aa  696    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.619711  normal  0.51907 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1673  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  46.32 
 
 		 778 aa  688    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0292  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  46.97 
 
 		 805 aa  757    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0690  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  47.67 
 
 		 787 aa  734    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.676741  normal  0.475894 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0204  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  86.23 
 
 		 806 aa  1442    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00731411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0434  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  100 
 
 		 806 aa  1668    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0475  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  41.27 
 
 		 768 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.908557  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0105  acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha  41.54 
 
 		 766 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1270  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  23.55 
 
 		 673 aa  57  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00748773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1461  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  24.01 
 
 		 656 aa  55.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000668721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1203  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  22.38 
 
 		 674 aa  55.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3780  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  20.33 
 
 		 674 aa  54.7  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.288316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2017  electron transport complex protein RnfC  40.28 
 
 		 558 aa  53.9  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2197  electron transport complex protein RnfC  27.81 
 
 		 788 aa  52.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0263  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC  27.97 
 
 		 437 aa  53.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1870  electron transport complex protein RnfC  34.94 
 
 		 716 aa  52  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00517809  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2895  electron transport complex protein RnfC  29.35 
 
 		 523 aa  49.7  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.473495  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04490  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  20.54 
 
 		 632 aa  48.9  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1972  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  24.35 
 
 		 655 aa  48.9  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000154748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0936  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  34.15 
 
 		 609 aa  48.5  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.787123  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1494  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  29.59 
 
 		 503 aa  48.1  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2310  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.7 
 
 		 430 aa  48.1  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0852323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2793  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.97 
 
 		 417 aa  47.8  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.77 
 
 		 427 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395761  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1384  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.27 
 
 		 453 aa  47  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000311988  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3028  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  24.38 
 
 		 625 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4498  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  28.05 
 
 		 663 aa  47.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1171  bifunctional acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha/beta  26.4 
 
 		 763 aa  46.2  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4113  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  27.63 
 
 		 416 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.774885  normal  0.0186832 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02966  electron transport complex protein RnfC  34.94 
 
 		 912 aa  47  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0566  protein of unknown function DUF162  22.36 
 
 		 710 aa  46.6  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3061  aldo/keto reductase  35.62 
 
 		 371 aa  46.6  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000337761  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0884  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  20.58 
 
 		 653 aa  46.2  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17634  normal  0.977834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3184  bifunctional acetyl-CoA decarbonylase/synthase complex subunit alpha/beta  28.05 
 
 		 736 aa  45.8  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2275  electron transport complex protein RnfC  31.15 
 
 		 876 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169634  normal  0.804532 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2110  electron transport complex protein RnfC  31.15 
 
 		 888 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.524779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0699  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  28.04 
 
 		 442 aa  45.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2063  electron transport complex protein RnfC  31.15 
 
 		 885 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00525621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0882  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  28.7 
 
 		 635 aa  45.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0536  electron transport complex protein RnfC  36.76 
 
 		 773 aa  44.7  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000392819  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2904  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.73 
 
 		 418 aa  44.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0967  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.5 
 
 		 442 aa  44.7  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2929  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  30.08 
 
 		 423 aa  44.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2233  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  21.83 
 
 		 629 aa  44.3  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1133  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  23.69 
 
 		 629 aa  44.3  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.394682  normal  0.139391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2327  carbon-monoxide dehydrogenase, catalytic subunit  27.63 
 
 		 621 aa  44.3  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00453727  normal  0.0261188 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4547  electron transport complex protein RnfC  31.15 
 
 		 884 aa  44.3  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2261  electron transport complex protein RnfC  31.15 
 
 		 884 aa  44.3  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0443736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>