43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1745 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1745  ferredoxin  100 
 
 		 249 aa  518  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4094  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 264 aa  200  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.405546 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0981  ferredoxin  38.57 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.0000000000000024477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1250  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.61 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0849107  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2666  ferredoxin  36.44 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2912  ferredoxin  30.99 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0453535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4302  ferredoxin  28.71 
 
 		 212 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0232293  decreased coverage  0.00591576 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4590  ferredoxin:4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  29.27 
 
 		 212 aa  92  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3934  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.42 
 
 		 220 aa  89.4  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1494  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.63 
 
 		 503 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.454099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0403  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  26.99 
 
 		 490 aa  49.3  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.864832 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1592  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25.3 
 
 		 494 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.220062  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3052  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  23.71 
 
 		 481 aa  48.9  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1870  electron transport complex protein RnfC  29.59 
 
 		 716 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00517809  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0943  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  38.03 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0115559  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  24.9 
 
 		 494 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.573606  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0085  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  24.85 
 
 		 489 aa  47  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0320  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  24.51 
 
 		 494 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1571  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  31.43 
 
 		 438 aa  46.2  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0522  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  24.51 
 
 		 494 aa  45.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  34.15 
 
 		 730 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0974  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.54 
 
 		 438 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2156  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  36.62 
 
 		 673 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.261031  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01881  NADH dehydrogenase subunit I  24.11 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2063  electron transport complex protein RnfC  27.01 
 
 		 885 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00525621  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4547  electron transport complex protein RnfC  27.01 
 
 		 884 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1344  NADH dehydrogenase subunit I  30 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2275  electron transport complex protein RnfC  27.01 
 
 		 876 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0169634  normal  0.804532 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2110  electron transport complex protein RnfC  27.01 
 
 		 888 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.524779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2261  electron transport complex protein RnfC  27.01 
 
 		 884 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0443736  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0161  NADH dehydrogenase subunit I  23.42 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1526  NADH dehydrogenase subunit I  25.23 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02321  NADH dehydrogenase subunit I  25.23 
 
 		 218 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01771  NADH dehydrogenase subunit I  23.42 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351878  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0220  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  22.84 
 
 		 487 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.804076  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1918  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  33.8 
 
 		 673 aa  42.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1848  electron transport complex protein RnfC  27.73 
 
 		 793 aa  42.7  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00264282  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01791  NADH dehydrogenase subunit I  23.42 
 
 		 208 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1372  hypothetical protein  32.1 
 
 		 423 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000298572  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1605  succinate dehydrogenase and fumarate reductase iron-sulfur protein  23.33 
 
 		 236 aa  42.4  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000156104  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1601  hydrogenase, Fe-only  23.08 
 
 		 582 aa  42  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2023  electron transport complex protein RnfC  26.95 
 
 		 747 aa  42  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2510  electron transport complex protein RnfC  26.47 
 
 		 790 aa  42  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>