173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1547 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1547  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  100 
 
 
280 aa  582  1.0000000000000001e-165  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0378845 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2099  heterodisulfide reductase, subunit C (HdrC-1)  83.57 
 
 
280 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1082  hypothetical protein  44.29 
 
 
240 aa  229  5e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.165945  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2185  hypothetical protein  46.12 
 
 
228 aa  228  8e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.32077  hitchhiker  0.00000000457726 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2555  iron-sulfur cluster-binding protein  46.12 
 
 
228 aa  228  8e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.461611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0632  iron-sulfur cluster-binding protein  45.77 
 
 
230 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0958053 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2216  hypothetical protein  44.66 
 
 
230 aa  223  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.278188  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0964  hypothetical protein  40.09 
 
 
239 aa  185  7e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.570063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1697  hypothetical protein  27.43 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000729724 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1953  heterodisulfide reductase subunit HdrC  26.72 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17750  hypothetical protein  36.27 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1325  heterodisulfide reductase, C subunit  32.5 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2098  heterodisulfide reductase, C subunit  38.96 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0975  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  33.33 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.826747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1028  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  37.8 
 
 
502 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00356665  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0358  putative heterodisulfide reductase, C subunit  33.33 
 
 
187 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0563  putative heterodisulfide reductase, C subunit  41.77 
 
 
211 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1351  heterodisulfide reductase, C subunit  30.53 
 
 
193 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.32 
 
 
196 aa  62.8  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.802269  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1201  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.57 
 
 
508 aa  62  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0710444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1335  heterodisulfide reductase, C subunit  31.96 
 
 
177 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0092  heterodisulfide reductase subunit  26.42 
 
 
182 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0032  heterodisulfide reductase subunit  27.36 
 
 
194 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0322  heterodisulfide reductase, C subunit  27.35 
 
 
186 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3675  putative heterodisulfide reductase, C subunit  28.4 
 
 
195 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.141926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3424  heterodisulfide reductase subunit  26.42 
 
 
216 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0861  heterodisulfide reductase subunit  32.47 
 
 
194 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1806  heterodisulfide reductase, C subunit  34.57 
 
 
189 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.577988 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1261  CoB--CoM heterodisulfide reductase  35.53 
 
 
502 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0640  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  25.17 
 
 
161 aa  60.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1108  heterodisulfide reductase, subunit C/succinate dehydrogenase, subunit C  32.26 
 
 
502 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.785263  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1176  hypothetical protein  28.24 
 
 
375 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.390877 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0151  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.25 
 
 
192 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3581  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.25 
 
 
192 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1452  hypothetical protein  27.21 
 
 
412 aa  59.3  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.275657 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0539  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  24.46 
 
 
184 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.214937  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1604  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  24.46 
 
 
184 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.455044  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0377  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.18 
 
 
184 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1700  putative heterodisulfide reductase, C subunit  30.26 
 
 
193 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000309238 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0308  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.46 
 
 
184 aa  59.3  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  34.21 
 
 
497 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0394  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.85 
 
 
189 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00274296  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0031  heterodisulfide reductase subunit  26.42 
 
 
194 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0417  putative heterodisulfide reductase, C subunit  32.79 
 
 
194 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.344766 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0198  heterodisulfide reductase subunit C  26.5 
 
 
213 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit C  27.18 
 
 
164 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000306335  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2317  heterodisulfide reductase subunit C  26.5 
 
 
213 aa  57.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1801  hypothetical protein  34.67 
 
 
372 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0826  heterodisulfide reductase, C subunit  29.67 
 
 
186 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.185232  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0841  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.03 
 
 
405 aa  56.6  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.936764  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1207  heterodisulfide reductase, C subunit  32.04 
 
 
204 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2344  putative heterodisulfide reductase, C subunit  35.44 
 
 
188 aa  56.6  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628999  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.47 
 
 
367 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.64 
 
 
190 aa  56.2  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000061408 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3574  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  25.23 
 
 
202 aa  55.8  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1285  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.99 
 
 
385 aa  55.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0820  putative heterodisulfide reductase, C subunit  29.41 
 
 
192 aa  55.8  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.123 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1252  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  29.55 
 
 
160 aa  55.8  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0439  heterodisulfide reductase subunit C-like  31.25 
 
 
156 aa  55.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1196  heterodisulfide reductase, C subunit  26.47 
 
 
184 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1882  heterodisulfide reductase subunit C  24.28 
 
 
195 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1574  putative heterodisulfide reductase, C subunit  22.58 
 
 
174 aa  54.3  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3531  DNA binding domain-containing protein  27.78 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.635038  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3961  DNA binding domain-containing protein  24.66 
 
 
314 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.21 
 
 
192 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0402  CoB--CoM heterodisulfide reductase  26.21 
 
 
192 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0280446  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2103  heterodisulfide reductase subunit C (HdrC-2)  25.93 
 
 
230 aa  53.9  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.666222  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0220  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  33.59 
 
 
487 aa  53.9  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.804076  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0633  putative heterodisulfide reductase, C subunit  25 
 
 
200 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1517  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit C  26.21 
 
 
192 aa  53.9  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.507445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2663  Heterodisulfide reductase subunit C-like protein  32.5 
 
 
129 aa  52.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0848  heterodisulfide reductase, C subunit  30.26 
 
 
202 aa  52.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1646  heterodisulfide reductase subunit C  26.73 
 
 
210 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2241  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit C  26.09 
 
 
194 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0469153  normal  0.0166067 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0700  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  27.73 
 
 
408 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66224  normal  0.217248 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2654  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  26.61 
 
 
408 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0782897 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0248  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  27.73 
 
 
408 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0932552  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0622  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  28.57 
 
 
408 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0494165  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0732  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  27.73 
 
 
408 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0648  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  28.57 
 
 
408 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0474  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.24 
 
 
193 aa  50.8  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.561183  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1543  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  24.76 
 
 
230 aa  50.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0154389 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0625  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.77 
 
 
193 aa  50.1  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1289  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  27.42 
 
 
408 aa  49.7  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2794  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.67 
 
 
934 aa  49.7  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0771  oxidoreductase, selenocysteine-containing  35.06 
 
 
432 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.457197  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1161  heterodisulfide reductase subunit C-like protein  27.18 
 
 
203 aa  48.9  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.860285  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2341  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.9 
 
 
439 aa  48.9  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3818  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  25.81 
 
 
408 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220496  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1836  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  26.02 
 
 
191 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139025  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0320  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  28.7 
 
 
494 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3345  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  26.61 
 
 
408 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2085  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  28.07 
 
 
387 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.32982  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1078  heterodisulfide reductase subunit C  34.92 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.114051  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2689  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  31.31 
 
 
419 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.430249  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0414  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.67 
 
 
451 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.137763 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4092  heterodisulfide reductase subunit C-like  29.11 
 
 
148 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3332  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  26.61 
 
 
408 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2599  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  26.61 
 
 
408 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0522  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  25.18 
 
 
494 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>