More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0808 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.07 
 
 
676 aa  679    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.91 
 
 
956 aa  665    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.217783 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.86 
 
 
979 aa  660    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.25 
 
 
960 aa  669    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.22 
 
 
676 aa  681    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.2 
 
 
984 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.04 
 
 
960 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.87 
 
 
947 aa  682    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.98 
 
 
925 aa  766    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0655  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.85 
 
 
978 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  37.35 
 
 
1012 aa  648    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.31 
 
 
967 aa  670    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.2 
 
 
966 aa  657    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.61 
 
 
1428 aa  737    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.09 
 
 
687 aa  676    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0557  molybdopterin oxidoreductase family protein  37.06 
 
 
978 aa  648    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  37.03 
 
 
979 aa  645    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0499  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  36.95 
 
 
978 aa  646    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.14 
 
 
979 aa  645    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0501  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  36.95 
 
 
978 aa  646    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3281  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.03 
 
 
979 aa  644    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.2 
 
 
984 aa  661    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.91 
 
 
955 aa  694    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.2 
 
 
984 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.06 
 
 
956 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.18 
 
 
937 aa  735    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  52.4 
 
 
695 aa  688    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2853  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.89 
 
 
960 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.771386 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2856  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.54 
 
 
959 aa  635    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  38.2 
 
 
984 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.8 
 
 
688 aa  676    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1080  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  37.87 
 
 
960 aa  644    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.33 
 
 
983 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  48.04 
 
 
689 aa  645    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.86 
 
 
963 aa  664    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.2 
 
 
984 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.93 
 
 
973 aa  645    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.29 
 
 
674 aa  687    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0589  molybdopterin oxidoreductase family protein  37.06 
 
 
978 aa  648    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  37.03 
 
 
979 aa  645    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.75 
 
 
1424 aa  729    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  48.25 
 
 
1412 aa  730    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.73 
 
 
674 aa  691    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  47.66 
 
 
745 aa  659    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  51.17 
 
 
899 aa  875    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.42 
 
 
984 aa  662    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.94 
 
 
1425 aa  725    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.2 
 
 
984 aa  660    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.95 
 
 
948 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.12 
 
 
952 aa  659    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.39 
 
 
917 aa  887    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.25 
 
 
959 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.31 
 
 
1425 aa  730    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.42 
 
 
677 aa  722    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.96 
 
 
989 aa  720    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2558  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.84 
 
 
973 aa  643    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.779669  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.68 
 
 
963 aa  723    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3269  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.2 
 
 
942 aa  687    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.25 
 
 
1410 aa  746    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.88 
 
 
674 aa  689    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.06 
 
 
948 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.49 
 
 
688 aa  639    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.29 
 
 
949 aa  682    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.83 
 
 
945 aa  734    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  37.6 
 
 
982 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.8 
 
 
948 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  40 
 
 
953 aa  695    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  37.29 
 
 
957 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2746  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.14 
 
 
1004 aa  650    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94455  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.07 
 
 
924 aa  677    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.49 
 
 
983 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.33 
 
 
929 aa  663    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.37 
 
 
676 aa  678    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.42 
 
 
944 aa  693    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.69 
 
 
1432 aa  723    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.94 
 
 
1432 aa  728    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.23 
 
 
927 aa  710    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.36 
 
 
1406 aa  714    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4406  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.18 
 
 
950 aa  650    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1473  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.39 
 
 
947 aa  641    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0442327  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3089  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.76 
 
 
959 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440267  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.14 
 
 
933 aa  714    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.33 
 
 
983 aa  662    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  36.93 
 
 
977 aa  649    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.2 
 
 
984 aa  661    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.71 
 
 
983 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.49 
 
 
983 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.8 
 
 
1440 aa  749    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.82 
 
 
1440 aa  738    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.37 
 
 
920 aa  829    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0505  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.55 
 
 
980 aa  650    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.64 
 
 
946 aa  651    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.03 
 
 
674 aa  692    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.66 
 
 
978 aa  650    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  38.23 
 
 
909 aa  640    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.41 
 
 
905 aa  759    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.94 
 
 
1432 aa  730    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.18 
 
 
1421 aa  743    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2741  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.92 
 
 
960 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.313061 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  48 
 
 
904 aa  836    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>