More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2469 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  67.88 
 
 
844 aa  902    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  65.26 
 
 
732 aa  854    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  65.83 
 
 
858 aa  902    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  67.88 
 
 
844 aa  902    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  62.18 
 
 
834 aa  937    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  67.88 
 
 
839 aa  902    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  64.95 
 
 
787 aa  853    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  62.33 
 
 
698 aa  818    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  68.34 
 
 
850 aa  997    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
846 aa  1691    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  65.4 
 
 
870 aa  905    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  67.88 
 
 
928 aa  902    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  58.63 
 
 
810 aa  905    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  76.85 
 
 
846 aa  1135    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  64.8 
 
 
742 aa  852    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  66.32 
 
 
862 aa  906    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  67.88 
 
 
844 aa  902    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  67.88 
 
 
844 aa  902    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  65.2 
 
 
888 aa  880    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  65.54 
 
 
857 aa  907    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  68.24 
 
 
787 aa  896    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  69.23 
 
 
821 aa  949    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  65.41 
 
 
728 aa  855    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  63.16 
 
 
678 aa  785    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  61.67 
 
 
675 aa  792    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  68.84 
 
 
801 aa  902    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  64.32 
 
 
838 aa  952    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  76.94 
 
 
846 aa  1137    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  60.45 
 
 
686 aa  794    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  66.62 
 
 
857 aa  897    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  70 
 
 
826 aa  985    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  65.79 
 
 
841 aa  891    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  65.71 
 
 
743 aa  862    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  66.62 
 
 
857 aa  897    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  67.88 
 
 
839 aa  902    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  66.47 
 
 
743 aa  868    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  65.71 
 
 
743 aa  862    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  48.95 
 
 
783 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  37.29 
 
 
850 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  39.21 
 
 
743 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  37.85 
 
 
854 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  39.24 
 
 
750 aa  427  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  38.24 
 
 
740 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  38.71 
 
 
774 aa  420  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  38.28 
 
 
762 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  39.72 
 
 
755 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  36.36 
 
 
762 aa  419  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  40.16 
 
 
730 aa  415  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  35.3 
 
 
815 aa  412  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  35.67 
 
 
786 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  36.44 
 
 
772 aa  398  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  38.3 
 
 
752 aa  397  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  35.42 
 
 
794 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  34.28 
 
 
786 aa  390  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  37.84 
 
 
760 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  34.69 
 
 
785 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  33.76 
 
 
759 aa  388  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  33.84 
 
 
767 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  35.97 
 
 
907 aa  383  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 
768 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  34.36 
 
 
765 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  35.32 
 
 
773 aa  363  6e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  33.38 
 
 
776 aa  356  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  34.39 
 
 
681 aa  321  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  34.13 
 
 
819 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  33.66 
 
 
778 aa  303  7.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  33.97 
 
 
792 aa  299  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  32.05 
 
 
791 aa  298  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  32.01 
 
 
790 aa  298  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  34.11 
 
 
791 aa  298  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  31.2 
 
 
830 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  31.84 
 
 
794 aa  295  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  31.69 
 
 
779 aa  294  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  34.39 
 
 
646 aa  294  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  32.22 
 
 
797 aa  293  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  31.61 
 
 
843 aa  293  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  33.57 
 
 
793 aa  291  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  30.97 
 
 
830 aa  290  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  30.61 
 
 
823 aa  290  8e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  30.82 
 
 
794 aa  289  1e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  30.68 
 
 
794 aa  289  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  30.99 
 
 
830 aa  289  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  29.11 
 
 
777 aa  289  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  33.08 
 
 
661 aa  287  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  31.06 
 
 
830 aa  288  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  32.13 
 
 
771 aa  287  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  31.48 
 
 
824 aa  287  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  31.37 
 
 
805 aa  287  5e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  32.91 
 
 
790 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.63 
 
 
817 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  31.1 
 
 
748 aa  284  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  32.95 
 
 
640 aa  281  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  32.48 
 
 
801 aa  281  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  30.8 
 
 
800 aa  281  4e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  31.5 
 
 
683 aa  281  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  31.5 
 
 
683 aa  280  8e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  32.03 
 
 
643 aa  280  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  32.03 
 
 
643 aa  280  8e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  31.35 
 
 
808 aa  280  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  28.29 
 
 
814 aa  280  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>