More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1943 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  100 
 
 
302 aa  609  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  78.33 
 
 
297 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  78.33 
 
 
297 aa  473  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  71.33 
 
 
299 aa  443  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  69 
 
 
298 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  70.26 
 
 
307 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  69.44 
 
 
295 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  66.67 
 
 
290 aa  381  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  59.93 
 
 
290 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  60.2 
 
 
291 aa  358  8e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  59.26 
 
 
290 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  60.54 
 
 
293 aa  355  6.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  60.4 
 
 
291 aa  353  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  58.25 
 
 
294 aa  350  1e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  59.18 
 
 
291 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  63.7 
 
 
278 aa  342  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  59.18 
 
 
291 aa  341  7e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  58.5 
 
 
291 aa  340  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  57.82 
 
 
291 aa  338  9e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  57.58 
 
 
290 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  58.72 
 
 
292 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  58.72 
 
 
292 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  60.71 
 
 
280 aa  330  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  57.72 
 
 
291 aa  328  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  56.38 
 
 
339 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  58.05 
 
 
291 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  56.38 
 
 
339 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  58.45 
 
 
300 aa  326  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  57.72 
 
 
291 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  56.38 
 
 
291 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  56.38 
 
 
291 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  56.38 
 
 
291 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  56.04 
 
 
291 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  57.38 
 
 
291 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  56.12 
 
 
291 aa  323  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  59.09 
 
 
275 aa  318  7e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  56.38 
 
 
291 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  56.38 
 
 
291 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  56.38 
 
 
291 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  60.45 
 
 
275 aa  317  2e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  58.33 
 
 
275 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  60.23 
 
 
278 aa  316  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  58.33 
 
 
275 aa  311  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  57.2 
 
 
268 aa  310  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  58.82 
 
 
256 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  55.52 
 
 
291 aa  309  2.9999999999999997e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  56.38 
 
 
291 aa  305  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  56.98 
 
 
275 aa  305  9.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  56.65 
 
 
271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  56.44 
 
 
269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  56.44 
 
 
267 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  56.27 
 
 
271 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  56.44 
 
 
269 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  56.27 
 
 
271 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  56.65 
 
 
271 aa  302  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  56.65 
 
 
271 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  56.46 
 
 
290 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  57.03 
 
 
291 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  57.03 
 
 
291 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  57.03 
 
 
291 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  56.46 
 
 
290 aa  299  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  56.46 
 
 
290 aa  299  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  57.03 
 
 
291 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  55.51 
 
 
270 aa  297  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  46.93 
 
 
277 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  52.79 
 
 
270 aa  265  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  50.18 
 
 
290 aa  252  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  48.43 
 
 
287 aa  246  3e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  36.57 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  35.89 
 
 
261 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  34.87 
 
 
246 aa  127  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  34.02 
 
 
248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  36.56 
 
 
324 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  33.33 
 
 
247 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  30.68 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2503  carboxymethylenebutenolidase  30.31 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  32.94 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7870  putative carboxymethylenebutenolidase  36.91 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  36.49 
 
 
238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5319  Carboxymethylenebutenolidase  35.47 
 
 
223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.319881  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0241  carboxymethylenebutenolidase  38.72 
 
 
229 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  35.89 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  36.52 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  30.42 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1199  Carboxymethylenebutenolidase  33.8 
 
 
214 aa  113  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4876  carboxymethylenebutenolidase  33.8 
 
 
254 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  35.09 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0111  carboxymethylenebutenolidase  32.07 
 
 
232 aa  109  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0321  carboxymethylenebutenolidase  35.62 
 
 
229 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  36.44 
 
 
227 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  30.29 
 
 
248 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0188  carboxymethylenebutenolidase  35.78 
 
 
229 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188287  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  31.05 
 
 
246 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1220  carboxymethylenebutenolidase  35.71 
 
 
229 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  36.52 
 
 
295 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  30.83 
 
 
244 aa  106  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0608  carboxymethylenebutenolidase  32.77 
 
 
272 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  32.54 
 
 
250 aa  105  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3379  carboxymethylenebutenolidase  32.89 
 
 
230 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0260  carboxymethylenebutenolidase  33.75 
 
 
229 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>