More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2276 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  100 
 
 
307 aa  613  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  39.02 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  38.21 
 
 
310 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  38.21 
 
 
310 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  42.72 
 
 
305 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  38.11 
 
 
304 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0225  ribokinase  40.63 
 
 
317 aa  191  1e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  43.42 
 
 
308 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  44.15 
 
 
302 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  44.48 
 
 
302 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  43.18 
 
 
295 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  43.56 
 
 
308 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  44.52 
 
 
312 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  44.11 
 
 
305 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  42.3 
 
 
315 aa  185  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2838  ribokinase  41.42 
 
 
314 aa  185  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760591  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  43.52 
 
 
310 aa  185  9e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  42.24 
 
 
306 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  40.4 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3280  ribokinase  43.79 
 
 
305 aa  183  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  42.53 
 
 
308 aa  182  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  37.09 
 
 
307 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  44.15 
 
 
302 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  45.15 
 
 
302 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4074  ribokinase  36.81 
 
 
306 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.532803  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4019  ribokinase  36.81 
 
 
306 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4182  ribokinase  36.81 
 
 
306 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4003  ribokinase  36.81 
 
 
306 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4124  ribokinase  36.81 
 
 
306 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  41.39 
 
 
299 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  40.06 
 
 
313 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4200  ribokinase  45.79 
 
 
326 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0696  ribokinase  39.67 
 
 
304 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 
306 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  35.29 
 
 
306 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0865  ribokinase  37.99 
 
 
305 aa  179  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.657252 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  40.46 
 
 
308 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  38.76 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0794  ribokinase family sugar kinase  37.66 
 
 
313 aa  179  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0266657  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  43.73 
 
 
309 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  44.3 
 
 
308 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  44.3 
 
 
308 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  43.73 
 
 
309 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  43.73 
 
 
309 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  43.73 
 
 
309 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  43.41 
 
 
309 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  38.39 
 
 
311 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  40.52 
 
 
306 aa  176  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  39.27 
 
 
297 aa  176  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0749  ribokinase  35.95 
 
 
306 aa  176  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000720941  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  39.26 
 
 
305 aa  176  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2877  ribokinase-like domain-containing protein  44.48 
 
 
300 aa  176  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.98714  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  40.26 
 
 
305 aa  176  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  44.88 
 
 
309 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  40.59 
 
 
308 aa  175  8e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4749  ribokinase  43.62 
 
 
309 aa  175  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  42.02 
 
 
297 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  39.94 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  44.88 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  42.57 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3765  ribokinase  44.97 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0637373 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1130  ribokinase  44.3 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1610  ribokinase  44.3 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231434  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  40.78 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  38.59 
 
 
307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1612  ribokinase family sugar kinase  33.55 
 
 
340 aa  172  5.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0874983  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  38.69 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  40.73 
 
 
302 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2296  PfkB domain-containing protein  41.88 
 
 
306 aa  172  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230241  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1587  ribokinase  44.3 
 
 
311 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338475  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  44.77 
 
 
302 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0179509 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  42.24 
 
 
309 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  42.24 
 
 
309 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  44.78 
 
 
308 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  42.24 
 
 
309 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  42.24 
 
 
309 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  42.24 
 
 
314 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  40.79 
 
 
320 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  42.24 
 
 
314 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  42.24 
 
 
309 aa  171  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3179  ribokinase  37.33 
 
 
303 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  37.9 
 
 
327 aa  170  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  42.24 
 
 
309 aa  170  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  40.79 
 
 
320 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0053  PfkB domain protein  39.93 
 
 
299 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  40.07 
 
 
305 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0252  ribokinase  42.81 
 
 
307 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.377165  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  41.33 
 
 
296 aa  169  6e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  39.67 
 
 
308 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  39.67 
 
 
308 aa  169  7e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  37.67 
 
 
303 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  40.26 
 
 
310 aa  168  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  37.67 
 
 
303 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  39.67 
 
 
308 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3580  ribokinase  38 
 
 
303 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3648  ribokinase  38 
 
 
303 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.16351  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  35.57 
 
 
307 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  40.26 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  35.37 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  33.82 
 
 
345 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>