More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3032 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 		 304 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  98.03 
 
 		 304 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  96.38 
 
 		 304 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  73.33 
 
 		 316 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  33.8 
 
 		 342 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  35.24 
 
 		 336 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.1 
 
 		 324 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  34.97 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  29.41 
 
 		 326 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.51 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  28.23 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.21 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.62 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  33.08 
 
 		 343 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  26.28 
 
 		 356 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  26.28 
 
 		 356 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  32.74 
 
 		 369 aa  99.8  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  31.23 
 
 		 339 aa  96.3  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  29 
 
 		 267 aa  95.5  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.69 
 
 		 409 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0505  folate-binding protein YgfZ  33.74 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.76 
 
 		 349 aa  92.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  33.33 
 
 		 328 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2127  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  37.44 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2092  hypothetical protein  32.33 
 
 		 261 aa  90.9  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.96 
 
 		 367 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  31.27 
 
 		 361 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0230  folate-binding protein YgfZ  28.47 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.96 
 
 		 361 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  30.31 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.31 
 
 		 356 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  30.31 
 
 		 356 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.85 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.22 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  33.84 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  25 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  33.33 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  32.96 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.4 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  32.89 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  27.21 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  30.4 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  29.7 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  30.28 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  27.38 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  32.2 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4019  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.89 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1102  folate-binding protein YgfZ  34.84 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.81 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1100  folate-binding protein YgfZ  27.65 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.47 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.97 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4761  hypothetical protein  33.7 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  30.18 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  30.46 
 
 		 398 aa  76.6  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2950  hypothetical protein  28.17 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  27.86 
 
 		 357 aa  75.9  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.1 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  37.4 
 
 		 327 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54480  hypothetical protein  32.84 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.812982 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.46 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.46 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1164  folate-binding protein YgfZ  22.39 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602813  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.18 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  29.06 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.86 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.32 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  30.72 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.6 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0712  folate-binding protein YgfZ  30.45 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537236 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.08 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  26.5 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0748  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.08 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  26.99 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  27.27 
 
 		 384 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1985  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.88 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.88 
 
 		 374 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  25.72 
 
 		 364 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2375  putative glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.73 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2505  folate-binding protein YgfZ  28.91 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438476  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  29.3 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.34 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1354  glycine cleavage system T protein  23.18 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.91248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4863  glycine cleavage system T protein  25.17 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1462  glycine cleavage system T protein aminomethyltransferase  31.18 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.34 
 
 		 430 aa  69.3  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  27.81 
 
 		 389 aa  69.3  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25 
 
 		 376 aa  69.3  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  27.3 
 
 		 386 aa  68.9  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  27.3 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28552  predicted protein  32.13 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177666  hitchhiker  0.000000277252 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.48 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  28.38 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2255  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.333338  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.73 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0047  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.66 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.21464  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.53 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5134  aminomethyltransferase  28.4 
 
 		 757 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3099  folate-binding protein YgfZ  29.17 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.623052 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.86 
 
 		 282 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.503998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>