244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5037 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 		 369 aa  726    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  54.01 
 
 		 364 aa  318  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  49.28 
 
 		 376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  51.16 
 
 		 356 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  51.16 
 
 		 356 aa  302  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  50.87 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  50.14 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  50.69 
 
 		 385 aa  296  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  53.8 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  50.3 
 
 		 369 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  52.58 
 
 		 361 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  51.06 
 
 		 367 aa  287  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  50.59 
 
 		 369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  52.15 
 
 		 328 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  48.78 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  48.99 
 
 		 328 aa  278  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  50 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  53.44 
 
 		 349 aa  275  7e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  45.45 
 
 		 389 aa  275  7e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  47.25 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  50.15 
 
 		 396 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  51.5 
 
 		 340 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  46.93 
 
 		 389 aa  267  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  48.51 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  51.96 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  46.78 
 
 		 344 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  48.04 
 
 		 399 aa  263  4e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  45.69 
 
 		 335 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  47.87 
 
 		 369 aa  260  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  47.75 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  47.8 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  45.71 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  46.36 
 
 		 361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  45.27 
 
 		 386 aa  231  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  45.59 
 
 		 398 aa  217  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  39.69 
 
 		 369 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  31.99 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  31.58 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  36.04 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  29.58 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  29.97 
 
 		 339 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.5 
 
 		 328 aa  99.4  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.63 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  30.11 
 
 		 384 aa  97.1  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  32.74 
 
 		 304 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  32.74 
 
 		 304 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  31.79 
 
 		 304 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  28.86 
 
 		 362 aa  89.4  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.86 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  30.56 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  28.92 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.37 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  30.55 
 
 		 322 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  28.43 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  26.69 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  26.69 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  25.86 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2375  putative glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.92 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.65 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0959  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.86 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1904  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.62 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.195861  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.95 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  27.09 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  25.76 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.37 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0217  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.57 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1013  folate-binding protein YgfZ  26.62 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  40.62 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.09 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4360  folate-binding protein YgfZ  30.34 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689561  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1737  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.25 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00179211  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.29 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.87 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.82 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2940  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.21 
 
 		 312 aa  62.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.352014  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4331  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.28 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.9 
 
 		 282 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.503998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5194  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.22 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2505  folate-binding protein YgfZ  27.42 
 
 		 345 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438476  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4304  folate-binding protein YgfZ  27.15 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5101  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.8 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1464  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.17 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.24907  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4673  folate-binding protein YgfZ  27.15 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363501  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.07 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5254  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.5 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1432  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.93 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.2 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.46 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1165  folate-binding protein YgfZ  25.09 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.818193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  26.18 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  31.09 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2127  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.72 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1112  folate-binding protein YgfZ  26.69 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1391  folate-binding protein YgfZ  26.69 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0376  hypothetical protein  28.04 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.482866  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  26.77 
 
 		 825 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  28.92 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4019  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.36 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1561  glycine cleavage system T protein  28.51 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4985  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 831 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0450258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>