202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0952 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 
389 aa  771    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  57.49 
 
 
367 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  58.02 
 
 
361 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  55.35 
 
 
356 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  55.08 
 
 
356 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  55.08 
 
 
356 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  54.26 
 
 
368 aa  339  4e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  45.69 
 
 
376 aa  309  5e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  49.73 
 
 
364 aa  308  6.999999999999999e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  48.77 
 
 
349 aa  285  9e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  49.74 
 
 
368 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  45.45 
 
 
369 aa  275  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.44 
 
 
369 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  45.89 
 
 
369 aa  261  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  44.88 
 
 
385 aa  243  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  44.76 
 
 
344 aa  243  5e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  44.34 
 
 
328 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  43.56 
 
 
343 aa  240  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  43.87 
 
 
328 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  42.94 
 
 
396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.08 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  41.81 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  42.05 
 
 
335 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  41.43 
 
 
352 aa  217  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  42.35 
 
 
340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  41.29 
 
 
361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  41.48 
 
 
379 aa  209  6e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  42.5 
 
 
361 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  42.97 
 
 
399 aa  207  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  38.59 
 
 
389 aa  202  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  40.74 
 
 
352 aa  201  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  40.83 
 
 
386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  41.28 
 
 
398 aa  196  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.71 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  60.49 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  35.21 
 
 
369 aa  143  5e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  24.52 
 
 
342 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  27.68 
 
 
325 aa  86.7  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.77 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  29.35 
 
 
316 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.53 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  38.73 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  26.44 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0959  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.57 
 
 
288 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.94 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  22.3 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  22.3 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2098  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  28.25 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.438328  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  24.32 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  25.8 
 
 
327 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.72 
 
 
328 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.06 
 
 
293 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.97 
 
 
282 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.503998 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  22.95 
 
 
326 aa  62.8  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.35 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.12 
 
 
293 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  27.81 
 
 
304 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.18 
 
 
293 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  27.81 
 
 
304 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4019  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.01 
 
 
293 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  26.96 
 
 
304 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.84 
 
 
337 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  26.15 
 
 
293 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  25.08 
 
 
322 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2622  glycine cleavage T-protein barrel  29.92 
 
 
287 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96003  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1720  glycine cleavage system T protein  26.45 
 
 
365 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.845128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2199  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.87 
 
 
339 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  25.16 
 
 
348 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  27.44 
 
 
344 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2505  folate-binding protein YgfZ  26.49 
 
 
345 aa  57  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438476  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4331  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.37 
 
 
293 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2375  putative glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.83 
 
 
294 aa  56.6  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1013  folate-binding protein YgfZ  35.11 
 
 
284 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0340  putative aminomethyl transferase  34.04 
 
 
305 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  26.63 
 
 
375 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  26.9 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1100  folate-binding protein YgfZ  34.23 
 
 
279 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1464  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.62 
 
 
354 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.24907  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1904  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.82 
 
 
334 aa  54.3  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.195861  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0691  folate-binding protein YgfZ  27.78 
 
 
276 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0376  hypothetical protein  33.57 
 
 
267 aa  53.5  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.482866  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4132  putative aminomethyltransferase  21.69 
 
 
324 aa  53.5  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.510492  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0500  glycine cleavage system T protein  25.64 
 
 
371 aa  53.5  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0479  aminomethyltransferase  26.92 
 
 
286 aa  53.5  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4673  folate-binding protein YgfZ  26.09 
 
 
284 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363501  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1165  folate-binding protein YgfZ  33.59 
 
 
284 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.818193  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1462  glycine cleavage system T protein aminomethyltransferase  40 
 
 
279 aa  53.1  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00606  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  36.73 
 
 
268 aa  53.1  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.52 
 
 
309 aa  52.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4821  folate-binding protein YgfZ  23.92 
 
 
285 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1737  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.21 
 
 
348 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00179211  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4304  folate-binding protein YgfZ  25.72 
 
 
284 aa  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1164  folate-binding protein YgfZ  29.9 
 
 
302 aa  51.2  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602813  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1085  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.52 
 
 
309 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000414438  hitchhiker  0.0000000121971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.59 
 
 
292 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0727  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  18.57 
 
 
354 aa  50.4  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639994  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1832  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.24 
 
 
344 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0667  aminomethyltransferase, putative  29.41 
 
 
287 aa  50.1  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0660  folate-binding protein YgfZ  29.41 
 
 
287 aa  50.1  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.439221  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4761  hypothetical protein  32.43 
 
 
314 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>