More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1254 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 		 322 aa  648    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  54.69 
 
 		 324 aa  322  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  55.52 
 
 		 337 aa  302  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  40.75 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.33 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  33.97 
 
 		 325 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  31.78 
 
 		 356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  31.78 
 
 		 356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  35.74 
 
 		 326 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.87 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  39.52 
 
 		 344 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  33.86 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  31.01 
 
 		 354 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  35.5 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  33.33 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  34.38 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  32.92 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  34.58 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  34.92 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  30.67 
 
 		 367 aa  113  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12239  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.55 
 
 		 379 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0923739  normal  0.265533 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  32.2 
 
 		 386 aa  109  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  29.09 
 
 		 371 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  31.35 
 
 		 362 aa  105  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  31.21 
 
 		 339 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.81 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.7 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.39 
 
 		 372 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1523  glycine cleavage system T protein  28.62 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  30.61 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3574  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.62 
 
 		 369 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0601666  normal  0.0493616 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  27.58 
 
 		 360 aa  102  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.67 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3132  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.57 
 
 		 371 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0347978  normal  0.607416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.88 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.97 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3371  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.97 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.577029  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2939  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.52 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  28.57 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  26.06 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.83 
 
 		 365 aa  99.4  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  30.8 
 
 		 384 aa  99.4  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3320  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.32 
 
 		 364 aa  99.4  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.095795 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.44 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.49 
 
 		 403 aa  96.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  25.96 
 
 		 365 aa  95.9  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  30.06 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  39.85 
 
 		 267 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.16 
 
 		 364 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.13 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  28.06 
 
 		 370 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  29.34 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.4 
 
 		 430 aa  94.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.96 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  26.51 
 
 		 371 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  30.7 
 
 		 364 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  33.07 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  26.3 
 
 		 361 aa  93.6  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  27.88 
 
 		 351 aa  93.2  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1782  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29 
 
 		 365 aa  92.4  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.186762 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2041  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.19 
 
 		 381 aa  92.8  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.044839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  32.08 
 
 		 368 aa  92  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.77 
 
 		 328 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  30.55 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  28.8 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  28.57 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1354  glycine cleavage system T protein  27.12 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.91248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2307  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.61 
 
 		 371 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4387  glycine cleavage system T protein  27.62 
 
 		 369 aa  89.7  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.18 
 
 		 362 aa  89.7  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.91 
 
 		 376 aa  89.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.15 
 
 		 369 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.15 
 
 		 369 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  29.1 
 
 		 343 aa  89  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.1 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.9 
 
 		 363 aa  88.6  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  30.1 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  30.1 
 
 		 356 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.08 
 
 		 365 aa  88.2  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  26.89 
 
 		 363 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 799 aa  87.8  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.25 
 
 		 360 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.83 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.25 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.95 
 
 		 360 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  28.76 
 
 		 349 aa  87  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  24.46 
 
 		 367 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.23 
 
 		 309 aa  86.3  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.48 
 
 		 359 aa  85.9  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  27.71 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.28 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.4 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.44 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  26.41 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  25.63 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  24.46 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.34 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  26.27 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  27.99 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.4 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>