More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1501 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 		 384 aa  767    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  74.22 
 
 		 375 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  58.91 
 
 		 386 aa  457  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  57.96 
 
 		 362 aa  434  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  29.18 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  27.89 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  27.75 
 
 		 367 aa  115  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  26.08 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  31.27 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.93 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.78 
 
 		 363 aa  107  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.39 
 
 		 370 aa  106  8e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  25.72 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3617  glycine cleavage system T protein  28.53 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  27.37 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.37 
 
 		 324 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  27.76 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2017  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.32 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00105963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  27.93 
 
 		 370 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  28.96 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  29.97 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.25 
 
 		 363 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.48 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.48 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  29.45 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01654  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.13 
 
 		 369 aa  97.4  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.69 
 
 		 359 aa  96.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.69 
 
 		 369 aa  96.7  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  29.43 
 
 		 344 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  25.13 
 
 		 350 aa  96.3  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.9 
 
 		 369 aa  96.7  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  26.1 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  24.8 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  25.92 
 
 		 351 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4387  glycine cleavage system T protein  27.79 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  24.93 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.65 
 
 		 430 aa  94.7  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3003  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.92 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.53 
 
 		 360 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.26 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.26 
 
 		 360 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.07 
 
 		 364 aa  93.6  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.41 
 
 		 360 aa  93.2  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1523  glycine cleavage system T protein  26.91 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.47 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0143  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.13 
 
 		 372 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228599  normal  0.397791 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.72 
 
 		 352 aa  92  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  26.16 
 
 		 371 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3316  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.53 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0709071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  29.82 
 
 		 352 aa  90.5  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0882  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.7 
 
 		 382 aa  90.1  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.15 
 
 		 360 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.46 
 
 		 364 aa  89.7  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.13 
 
 		 365 aa  89.7  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  26.44 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0145  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.87 
 
 		 372 aa  89.7  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.731192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.52 
 
 		 347 aa  89.7  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0338  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.85 
 
 		 363 aa  89.7  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0368876  normal  0.123109 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.67 
 
 		 441 aa  89.4  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  27.22 
 
 		 348 aa  89.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  24.93 
 
 		 366 aa  89.7  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  27.3 
 
 		 361 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.71 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  25 
 
 		 356 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  25 
 
 		 356 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.7 
 
 		 409 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  29.02 
 
 		 368 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0133  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.87 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1190  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.35 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  25 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  27.32 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.85 
 
 		 360 aa  88.6  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  24.15 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.87 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3675  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.93 
 
 		 364 aa  87.8  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.05 
 
 		 360 aa  87.4  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.62 
 
 		 363 aa  87.4  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0159  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.61 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.74 
 
 		 364 aa  87  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.94 
 
 		 366 aa  87  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  23.47 
 
 		 375 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2909  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.61 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.803939  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.57 
 
 		 361 aa  87  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0146  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.61 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.04 
 
 		 372 aa  87  5e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0500  glycine cleavage system T protein  25.98 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0056  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.8 
 
 		 384 aa  86.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3064  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.12 
 
 		 364 aa  86.7  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0393389  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994.1  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.1 
 
 		 372 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0127  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.1 
 
 		 372 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3997  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.1 
 
 		 372 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1542  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.1 
 
 		 372 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3926  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.1 
 
 		 372 aa  86.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108105  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.2 
 
 		 364 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1515  glycine cleavage system T protein  22.79 
 
 		 356 aa  86.3  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00269982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.96 
 
 		 349 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3371  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.2 
 
 		 364 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.577029  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.1 
 
 		 372 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3061  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.1 
 
 		 372 aa  86.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  25.71 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>