228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5109 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 		 361 aa  696    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  81.84 
 
 		 367 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  79.11 
 
 		 356 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  79.11 
 
 		 356 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  78.83 
 
 		 356 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  72.68 
 
 		 368 aa  508  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  58.02 
 
 		 389 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  49.33 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  50.87 
 
 		 364 aa  306  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  52.03 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  52.58 
 
 		 369 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  47.22 
 
 		 409 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  52.12 
 
 		 368 aa  262  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  48.12 
 
 		 369 aa  250  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  47.19 
 
 		 385 aa  243  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.67 
 
 		 369 aa  242  7.999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  45.1 
 
 		 343 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  49.4 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  46.35 
 
 		 344 aa  226  6e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  45.59 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  43.97 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  44.74 
 
 		 340 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  44.48 
 
 		 335 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  43.98 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  42.55 
 
 		 389 aa  212  7.999999999999999e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  43.65 
 
 		 396 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  40.68 
 
 		 369 aa  190  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  44.11 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.41 
 
 		 361 aa  189  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  42.06 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  42.41 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  41.76 
 
 		 399 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.77 
 
 		 352 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  41.82 
 
 		 386 aa  178  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  42.52 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  37.17 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  30.45 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  30.09 
 
 		 325 aa  95.9  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  31.96 
 
 		 336 aa  92.8  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  25.75 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  25.75 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  30.24 
 
 		 304 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.23 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.71 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  30.18 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1464  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.49 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.24907  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  32.53 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  31.96 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  28.65 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  31.27 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  31.27 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.96 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  25.84 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.88 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.87 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  28.33 
 
 		 348 aa  73.9  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  27.31 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  30.49 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  29.28 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.74 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4331  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.79 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.83 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2199  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.27 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.04 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  27.56 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1904  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.78 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.195861  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.55 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2098  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  27.55 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.438328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2375  putative glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.48 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  29.01 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  26.04 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0959  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  45.33 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03031  GcvT-like aminomethyltransferase  26.88 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.000485176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0712  folate-binding protein YgfZ  31.13 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537236 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.17 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.69 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4821  folate-binding protein YgfZ  26.58 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.46 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1164  folate-binding protein YgfZ  23.02 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602813  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  22.84 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2505  folate-binding protein YgfZ  25.99 
 
 		 345 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438476  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1462  glycine cleavage system T protein aminomethyltransferase  27.6 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0350  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.83 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.536076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4132  putative aminomethyltransferase  22.05 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.510492  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1357  glycine cleavage T protein  27.24 
 
 		 313 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1830  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.99 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1354  glycine cleavage system T protein  24.57 
 
 		 371 aa  53.9  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.91248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4190  putative global regulator  27.51 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5194  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.29 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5254  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.54 
 
 		 360 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1100  folate-binding protein YgfZ  36.73 
 
 		 279 aa  53.5  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4019  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.52 
 
 		 293 aa  53.1  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02730  putative global regulator  27.51 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.302082  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0794  folate-binding protein YgfZ  27.51 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02693  hypothetical protein  27.51 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.345451  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3225  putative global regulator  27.51 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3057  putative global regulator  27.51 
 
 		 326 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0117  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.11 
 
 		 360 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  28.04 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5101  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.18 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>