More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0954 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  100 
 
 		 344 aa  692    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  48.26 
 
 		 349 aa  278  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.5 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  48.53 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  46.91 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  46.91 
 
 		 356 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  46.06 
 
 		 326 aa  269  5e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  44.3 
 
 		 354 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.06 
 
 		 324 aa  166  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  39.52 
 
 		 322 aa  165  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  32.5 
 
 		 327 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.24 
 
 		 337 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  31.29 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  30.14 
 
 		 396 aa  97.1  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  31.77 
 
 		 343 aa  93.2  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  30.55 
 
 		 304 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  32.25 
 
 		 328 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  31.67 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  32.31 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  29.59 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  30.75 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.84 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.24 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  30.18 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.23 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.87 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.67 
 
 		 409 aa  79.3  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  30.18 
 
 		 304 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  29.88 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49341  predicted protein  25.55 
 
 		 661 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  29.82 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0230  hypothetical protein  43.36 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  30.22 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  30.55 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0259  hypothetical protein  40.74 
 
 		 265 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  29.79 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1832  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.13 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  27.02 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1804  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.13 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  27.68 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  30.97 
 
 		 379 aa  75.1  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  26.3 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.99 
 
 		 372 aa  72.8  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.66 
 
 		 385 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  27.44 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  23.87 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  30.38 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  28.73 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  28.73 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.73 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5195  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.71 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  29.87 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  26.14 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  25.83 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2197  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 815 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.031847 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03031  GcvT-like aminomethyltransferase  37.61 
 
 		 280 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.000485176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  29.29 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1379  folate-binding protein YgfZ  29.29 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  27.93 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 843 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.11 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.69 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1895  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.69 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  22.74 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24971  aminomethyltransferase GcvT-like protein  26.55 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2265  putative glycine cleavage T protein (aminomethyltransferase)  28.39 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  31.77 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.93 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.33 
 
 		 361 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  21.86 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  27.59 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0340  putative aminomethyl transferase  26.83 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  26.42 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0505  folate-binding protein YgfZ  28.24 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03561  GcvT-like aminomethyltransferase  39.6 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1642  hypothetical protein  39.6 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2152  glycine cleavage T-protein superfamily protein  28.39 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101306  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1937  folate-binding protein YgfZ  27.12 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.180565  normal  0.508771 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2322  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  27.12 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200302  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  25.16 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1427  hypothetical protein  27.12 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1191  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  27.12 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2445  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  27.12 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2283  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  27.12 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.695664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1918  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  27.12 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3386  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase) family protein  27.12 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1041  putative glycine cleavage T protein (aminomethyltransferase)  25.54 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2956  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.46 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3311  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 817 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0376  hypothetical protein  26.89 
 
 		 267 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.482866  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.1 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  28.74 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.99 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02991  aminomethyltransferase  29.01 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21611  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  21.86 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.532359 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.09 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  26.65 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.22 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 		 825 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1876  folate-binding protein YgfZ  27.35 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0515526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>