53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0230 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0230  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  524  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0259  hypothetical protein  56.37 
 
 		 265 aa  256  3e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24971  aminomethyltransferase GcvT-like protein  49.82 
 
 		 283 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03031  GcvT-like aminomethyltransferase  41.39 
 
 		 280 aa  202  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.000485176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1642  hypothetical protein  36 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03561  GcvT-like aminomethyltransferase  36 
 
 		 282 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02991  aminomethyltransferase  32.54 
 
 		 278 aa  139  7e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0278  hypothetical protein  32.57 
 
 		 278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03001  GcvT-like aminomethyltransferase  30.98 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0602305  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03091  aminomethyltransferase GcvT-like protein  30.77 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.603363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  27.49 
 
 		 354 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  29.41 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  44.34 
 
 		 344 aa  75.5  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  41.58 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  24.25 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.1 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  38.61 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  38.61 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.79 
 
 		 327 aa  67  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  27.89 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  28.73 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  27.14 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  29.28 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  37.86 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  26.09 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  35.71 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2127  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.94 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.05 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.48 
 
 		 337 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  25.88 
 
 		 304 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  26.27 
 
 		 304 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1985  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.48 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  28.32 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.49 
 
 		 292 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  26.52 
 
 		 328 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1164  folate-binding protein YgfZ  29.29 
 
 		 302 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602813  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.01 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3099  folate-binding protein YgfZ  28.63 
 
 		 291 aa  46.2  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.623052 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3198  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.35 
 
 		 322 aa  46.2  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1391  folate-binding protein YgfZ  25.5 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1112  folate-binding protein YgfZ  25.5 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0630  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.85 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.31258  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  25.83 
 
 		 369 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2736  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.98 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380224  normal  0.0365471 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.14 
 
 		 328 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1830  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.17 
 
 		 348 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0376  hypothetical protein  28.5 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.482866  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4132  putative aminomethyltransferase  22.64 
 
 		 324 aa  43.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.510492  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0340  putative aminomethyl transferase  28.99 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2535  hypothetical protein  25.1 
 
 		 318 aa  43.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1876  folate-binding protein YgfZ  25.32 
 
 		 319 aa  42.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0515526 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28552  predicted protein  26.53 
 
 		 306 aa  42.4  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177666  hitchhiker  0.000000277252 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.1 
 
 		 282 aa  42  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.503998 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>