64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_24971 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_24971  aminomethyltransferase GcvT-like protein  100 
 
 		 283 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0230  hypothetical protein  49.82 
 
 		 264 aa  240  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03031  GcvT-like aminomethyltransferase  45.56 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.000485176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0259  hypothetical protein  53.21 
 
 		 265 aa  228  8e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03561  GcvT-like aminomethyltransferase  37.1 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1642  hypothetical protein  36.75 
 
 		 282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02991  aminomethyltransferase  31.18 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0278  hypothetical protein  30.82 
 
 		 278 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03001  GcvT-like aminomethyltransferase  30.11 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0602305  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03091  aminomethyltransferase GcvT-like protein  30.32 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.603363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  25.33 
 
 		 354 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.82 
 
 		 327 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  26.48 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.44 
 
 		 349 aa  72.4  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  25.64 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  25.64 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  25.28 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  38.32 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  28.94 
 
 		 339 aa  65.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  35 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  34.65 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.46 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  26.12 
 
 		 325 aa  52.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  32.59 
 
 		 379 aa  52.8  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.84 
 
 		 328 aa  52.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1537  hypothetical protein  22.94 
 
 		 352 aa  52.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  30.08 
 
 		 322 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.1 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  27.78 
 
 		 342 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1446  hypothetical protein  22.22 
 
 		 352 aa  49.7  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28552  predicted protein  25.74 
 
 		 306 aa  49.3  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177666  hitchhiker  0.000000277252 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0340  putative aminomethyl transferase  27.27 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2736  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.21 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380224  normal  0.0365471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  29.37 
 
 		 328 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  32.37 
 
 		 369 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0505  folate-binding protein YgfZ  31.37 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  33.33 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  26.61 
 
 		 386 aa  47.4  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.67 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1985  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.45 
 
 		 248 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  34.86 
 
 		 369 aa  46.6  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.77 
 
 		 385 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0376  hypothetical protein  26.72 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.482866  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  24.91 
 
 		 316 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  24.46 
 
 		 389 aa  45.8  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  24.24 
 
 		 304 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  29.27 
 
 		 364 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3471  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.27 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  30.88 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  26.14 
 
 		 304 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  30 
 
 		 389 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  26.97 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  28.8 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  26.45 
 
 		 361 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  31.5 
 
 		 368 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.08 
 
 		 360 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  26.95 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3198  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.36 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  34 
 
 		 399 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0860  folate-binding protein YgfZ  28.71 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  30.83 
 
 		 398 aa  43.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3899  putative global regulator  25.84 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  36.59 
 
 		 344 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>