53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1642 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1642  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  580  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03561  GcvT-like aminomethyltransferase  97.52 
 
 		 282 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24971  aminomethyltransferase GcvT-like protein  36.75 
 
 		 283 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03031  GcvT-like aminomethyltransferase  36.4 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.000485176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0230  hypothetical protein  36 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0278  hypothetical protein  36.56 
 
 		 278 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02991  aminomethyltransferase  36.2 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03001  GcvT-like aminomethyltransferase  35.84 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0602305  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03091  aminomethyltransferase GcvT-like protein  35.51 
 
 		 282 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.603363  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0259  hypothetical protein  35.21 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  39 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  36.79 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  35.78 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  33.96 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  35.85 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  34.23 
 
 		 326 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  23.89 
 
 		 356 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  23.89 
 
 		 356 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  28.47 
 
 		 339 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  29.77 
 
 		 325 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  29.82 
 
 		 396 aa  50.8  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  23.57 
 
 		 267 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.57 
 
 		 337 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  24.44 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  24.44 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.44 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1533  folate-binding protein YgfZ  25.63 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  25.36 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  25 
 
 		 398 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.84 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.24 
 
 		 324 aa  46.2  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49341  predicted protein  32.1 
 
 		 661 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  45 
 
 		 385 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0340  putative aminomethyl transferase  22.05 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0376  hypothetical protein  21.91 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.482866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.43 
 
 		 409 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  40.43 
 
 		 344 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  27.35 
 
 		 322 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 827 aa  43.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  26.4 
 
 		 352 aa  43.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1164  folate-binding protein YgfZ  35.29 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602813  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  32.26 
 
 		 369 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  27.5 
 
 		 369 aa  42.7  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  20.07 
 
 		 342 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1446  hypothetical protein  27.66 
 
 		 352 aa  42.7  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  39.53 
 
 		 371 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.2 
 
 		 361 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1391  folate-binding protein YgfZ  23.91 
 
 		 321 aa  42.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  30.19 
 
 		 389 aa  42.4  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  39.58 
 
 		 825 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1112  folate-binding protein YgfZ  23.91 
 
 		 321 aa  42.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  25.6 
 
 		 361 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.26 
 
 		 360 aa  42.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>