26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49341 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_49341  predicted protein  100 
 
 
661 aa  1357    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  26.69 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  26.69 
 
 
356 aa  73.9  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.66 
 
 
349 aa  69.7  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.45 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  27.33 
 
 
354 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  25.95 
 
 
325 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  24.11 
 
 
326 aa  57.8  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2496  FAD dependent oxidoreductase  25.87 
 
 
830 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  27.2 
 
 
344 aa  53.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2504  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 
830 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.1116  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2459  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 
830 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.438367  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 
816 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.32 
 
 
365 aa  47.8  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  24.75 
 
 
375 aa  47.8  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  22.93 
 
 
386 aa  47  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3080  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 
816 aa  46.2  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.202627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  31.03 
 
 
396 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  24.75 
 
 
384 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1642  hypothetical protein  32.1 
 
 
282 aa  45.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03031  GcvT-like aminomethyltransferase  30.28 
 
 
280 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.000485176  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03561  GcvT-like aminomethyltransferase  32.1 
 
 
282 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.64 
 
 
366 aa  45.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  22.01 
 
 
825 aa  44.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1164  folate-binding protein YgfZ  35.29 
 
 
302 aa  43.9  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602813  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  26.92 
 
 
819 aa  43.9  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>