96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_03031 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_03031  GcvT-like aminomethyltransferase  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.000485176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24971  aminomethyltransferase GcvT-like protein  45.56 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0230  hypothetical protein  41.39 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0259  hypothetical protein  46.51 
 
 		 265 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1642  hypothetical protein  36.4 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03561  GcvT-like aminomethyltransferase  36.4 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02991  aminomethyltransferase  36.03 
 
 		 278 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03001  GcvT-like aminomethyltransferase  36.4 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0602305  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0278  hypothetical protein  33.33 
 
 		 278 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03091  aminomethyltransferase GcvT-like protein  33.09 
 
 		 282 aa  153  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.603363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  27.82 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.94 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  28.72 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  28.72 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  41.35 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  25.19 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.38 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  27.61 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  36.94 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.42 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  38.32 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  27.73 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.03 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.43 
 
 		 385 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  24.12 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  27.46 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.88 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  23.24 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  29.84 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  29.38 
 
 		 396 aa  58.9  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  21.86 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  26.44 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.44 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  26.44 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.4 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.86 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.01 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  27.69 
 
 		 340 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  28.76 
 
 		 328 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  27.14 
 
 		 304 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  29.93 
 
 		 369 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  29.66 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  21.22 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  26.05 
 
 		 386 aa  54.7  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  31.67 
 
 		 325 aa  53.9  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  28.69 
 
 		 304 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  26.44 
 
 		 352 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  28.69 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.42 
 
 		 369 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.12 
 
 		 368 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  26.81 
 
 		 389 aa  52.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.05 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  23.75 
 
 		 369 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  27.95 
 
 		 344 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  34.88 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  25.33 
 
 		 368 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  27.7 
 
 		 335 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  25.71 
 
 		 364 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  29.63 
 
 		 379 aa  48.9  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  22.78 
 
 		 316 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  28.43 
 
 		 349 aa  48.9  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  25.65 
 
 		 961 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.96 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  23.62 
 
 		 368 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28552  predicted protein  22.22 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177666  hitchhiker  0.000000277252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  30.5 
 
 		 369 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  22.76 
 
 		 398 aa  47.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  25.55 
 
 		 371 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  27.27 
 
 		 366 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  22.62 
 
 		 389 aa  47  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.81 
 
 		 363 aa  46.2  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  39.29 
 
 		 399 aa  45.8  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  27 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  25.55 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  29.13 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49341  predicted protein  30.28 
 
 		 661 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3161  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 827 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0505  folate-binding protein YgfZ  35.56 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2092  hypothetical protein  22.98 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  26.53 
 
 		 367 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4360  folate-binding protein YgfZ  25 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689561  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  20.49 
 
 		 360 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.95 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.26 
 
 		 380 aa  43.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  24.65 
 
 		 361 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2940  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.34 
 
 		 312 aa  42.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.352014  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1830  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.73 
 
 		 348 aa  42.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  24.64 
 
 		 376 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  23.62 
 
 		 362 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.54 
 
 		 366 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0318  aminomethyl transferase family protein  27.45 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  22.13 
 
 		 371 aa  42.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  23.77 
 
 		 360 aa  42.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0262  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  23.98 
 
 		 275 aa  42.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00715457  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.11 
 
 		 293 aa  42.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  23.36 
 
 		 369 aa  42  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>