294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8240 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 		 335 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  57.43 
 
 		 352 aa  361  1e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  60.54 
 
 		 328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  56.94 
 
 		 343 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  58.98 
 
 		 328 aa  349  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  56.85 
 
 		 340 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  53.19 
 
 		 360 aa  316  4e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  55.06 
 
 		 324 aa  315  8e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  48.11 
 
 		 409 aa  299  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  55.59 
 
 		 352 aa  295  9e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  50.81 
 
 		 379 aa  287  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  50.41 
 
 		 369 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  48.43 
 
 		 361 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  47.38 
 
 		 396 aa  275  7e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  47.51 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  48.15 
 
 		 399 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  47.51 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  48.86 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  45.69 
 
 		 369 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  48.75 
 
 		 386 aa  260  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  48.7 
 
 		 368 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  45.61 
 
 		 364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  45.22 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  45.95 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  45.05 
 
 		 369 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  39.78 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  42.05 
 
 		 389 aa  218  7.999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  42.59 
 
 		 368 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  44.48 
 
 		 361 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.08 
 
 		 367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  44.9 
 
 		 349 aa  212  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  42.48 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  42.48 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  42.48 
 
 		 356 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  41.54 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  38.87 
 
 		 369 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  27.62 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  32.25 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1100  folate-binding protein YgfZ  30.3 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.52 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  31.46 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0309  aminomethyl transferase family protein  26.4 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  28.25 
 
 		 384 aa  80.1  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  30.77 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4360  folate-binding protein YgfZ  29.73 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689561  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  30.4 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  25.87 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  28.19 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.92 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.22 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.34 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  26.25 
 
 		 356 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  26.25 
 
 		 356 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  27.59 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  27.08 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  27.76 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  26.17 
 
 		 354 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  26.44 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2950  hypothetical protein  28.75 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  24.83 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4821  folate-binding protein YgfZ  30.5 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  29.34 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  27.72 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0959  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.87 
 
 		 288 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1559  glycine cleavage system T protein  25.17 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0712  folate-binding protein YgfZ  27.13 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537236 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1985  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.22 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.43 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  28.8 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.66 
 
 		 324 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  26.95 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4388  folate-binding protein YgfZ  27.99 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410002  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.67 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.4 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4019  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.32 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0748  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.29 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02950  aminomethyltransferase  28.36 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1432  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.42 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.86 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.4 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0731  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.34 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607247  normal  0.0872303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2267  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  25.51 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1063  hypothetical protein  28.28 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0262  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  30.74 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00715457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2940  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.97 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.352014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  26.24 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2127  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.4 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.54 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.503998 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0860  folate-binding protein YgfZ  23.81 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  28.67 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  22.96 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0812  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.6 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000519539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1423  hypothetical protein  28.15 
 
 		 313 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4298  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.15 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1330  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.37 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.68 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0240  hypothetical protein  26.11 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.46 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5195  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.46 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377997 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1830  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.11 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0137829  normal  0.0659803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>