More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6837 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 
364 aa  715    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  62.2 
 
 
376 aa  451  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  54.01 
 
 
369 aa  318  9e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  51.38 
 
 
356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  51.38 
 
 
356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  51.38 
 
 
356 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  54.6 
 
 
368 aa  309  5e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  49.73 
 
 
389 aa  308  6.999999999999999e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  50.87 
 
 
361 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  52.54 
 
 
369 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  53.45 
 
 
369 aa  299  6e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  50.57 
 
 
368 aa  295  6e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  49.14 
 
 
367 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  49.28 
 
 
343 aa  291  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  51.84 
 
 
349 aa  289  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  47.77 
 
 
385 aa  288  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.43 
 
 
409 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  50.44 
 
 
360 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  48.29 
 
 
328 aa  278  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  48.55 
 
 
328 aa  276  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  48.45 
 
 
379 aa  265  8.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  45.73 
 
 
352 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  45.95 
 
 
340 aa  257  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  45.61 
 
 
335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  43.64 
 
 
344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  47.26 
 
 
396 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  45.09 
 
 
369 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  45.78 
 
 
399 aa  246  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  44.97 
 
 
389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  45.1 
 
 
361 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  44.97 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.66 
 
 
352 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  42.78 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  44.78 
 
 
398 aa  216  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  39.77 
 
 
386 aa  207  3e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  37.24 
 
 
369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.07 
 
 
349 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  30.23 
 
 
325 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  31.43 
 
 
336 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  30.89 
 
 
339 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  27.5 
 
 
354 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  27.46 
 
 
342 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.27 
 
 
327 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  31.56 
 
 
375 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.49 
 
 
347 aa  93.6  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  27.09 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  27.09 
 
 
356 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  27.27 
 
 
326 aa  87  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.85 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  28.48 
 
 
384 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  30.74 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2098  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  30 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.438328  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  29.52 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  29.1 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0500  glycine cleavage system T protein  30.4 
 
 
371 aa  79.3  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  30.24 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  30.57 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1737  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.6 
 
 
348 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00179211  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1464  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.62 
 
 
354 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.24907  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2505  folate-binding protein YgfZ  27.33 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.438476  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.58 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  26.85 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.58 
 
 
369 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  26.85 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  27.39 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1427  folate-binding protein YgfZ  29.13 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345601  normal  0.255059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.99 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1354  glycine cleavage system T protein  26.46 
 
 
371 aa  72.8  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.91248  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  28.16 
 
 
375 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  26.47 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0350  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.15 
 
 
360 aa  72.8  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.536076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.54 
 
 
364 aa  72  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.23 
 
 
364 aa  72  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1804  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.25 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.173465  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.64 
 
 
309 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1832  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.25 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1720  glycine cleavage system T protein  26.79 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.845128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2199  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.8 
 
 
339 aa  69.3  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.72 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  24.34 
 
 
371 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  24.71 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.01 
 
 
963 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.53 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4331  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.78 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5254  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.57 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55872  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  26.56 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1379  folate-binding protein YgfZ  29.24 
 
 
345 aa  67  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6184  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.68 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1895  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.38 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5194  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.57 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148183  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1041  putative glycine cleavage T protein (aminomethyltransferase)  26.78 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.255858  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5101  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.57 
 
 
360 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1468  folate-binding protein YgfZ  28.15 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606747  normal  0.0230828 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.76 
 
 
366 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.71 
 
 
370 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68870  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.87 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3073  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.81 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.116584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3962  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.51 
 
 
315 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.812707  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5195  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.57 
 
 
344 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.377997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>