70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_03091 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_03091  aminomethyltransferase GcvT-like protein  100 
 
 		 282 aa  568  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.603363  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0278  hypothetical protein  64.58 
 
 		 278 aa  364  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02991  aminomethyltransferase  64.73 
 
 		 278 aa  363  1e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03001  GcvT-like aminomethyltransferase  61.45 
 
 		 278 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0602305  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03031  GcvT-like aminomethyltransferase  34.77 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.000485176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1642  hypothetical protein  34.86 
 
 		 282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03561  GcvT-like aminomethyltransferase  35.21 
 
 		 282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24971  aminomethyltransferase GcvT-like protein  30 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0230  hypothetical protein  30.77 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0259  hypothetical protein  32.42 
 
 		 265 aa  135  8e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  25.44 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  34.86 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  40.35 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.15 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  40.74 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  46.15 
 
 		 326 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0138  aminomethyl transferase family protein  25.25 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.93 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  23.04 
 
 		 327 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  28.46 
 
 		 386 aa  50.4  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  19.31 
 
 		 360 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.46 
 
 		 328 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  21.32 
 
 		 267 aa  49.7  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  21.11 
 
 		 352 aa  48.5  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.81 
 
 		 385 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  38.33 
 
 		 356 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2956  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.22 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  38.33 
 
 		 356 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  26.02 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  25.23 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0505  folate-binding protein YgfZ  28.12 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  0.803186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  26.23 
 
 		 369 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  23.38 
 
 		 293 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.2 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0089  glycine cleavage T protein(aminomethyl transferase)  23.23 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  24.53 
 
 		 339 aa  46.2  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4019  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.52 
 
 		 293 aa  45.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2092  hypothetical protein  20.33 
 
 		 261 aa  46.2  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.03 
 
 		 324 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  24.41 
 
 		 389 aa  45.8  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  27.78 
 
 		 379 aa  45.8  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  21.84 
 
 		 369 aa  45.8  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  41.67 
 
 		 362 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  23.85 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.42 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  24.77 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0169  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.2 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  26.09 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4331  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.4 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  25.81 
 
 		 352 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  24.03 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  26.83 
 
 		 369 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0159  hypothetical protein  22.45 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000279437 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1294  aminomethyl transferase  21.4 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2020  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  21.79 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  26.87 
 
 		 376 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.12 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.86 
 
 		 409 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  31.37 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.32 
 
 		 324 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2535  hypothetical protein  25.96 
 
 		 318 aa  43.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.72 
 
 		 361 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  20.41 
 
 		 304 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0318  aminomethyl transferase family protein  26.05 
 
 		 310 aa  42.7  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.22 
 
 		 369 aa  42.7  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  23.44 
 
 		 368 aa  42.7  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  21.97 
 
 		 336 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0748  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  33.33 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.13 
 
 		 309 aa  42.4  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.83 
 
 		 293 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191945 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>