187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10826 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10826  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  714    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0841313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5109  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  72.68 
 
 		 361 aa  508  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.80079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4919  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  71.47 
 
 		 356 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4536  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  71.2 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.935602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4623  glycine cleavage T-protein, C-terminal barrel  71.2 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1638  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  70.03 
 
 		 367 aa  484  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.246382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0952  folate-binding protein YgfZ  54.26 
 
 		 389 aa  339  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  49.34 
 
 		 376 aa  318  9e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  50.57 
 
 		 364 aa  295  6e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3572  folate-binding protein YgfZ  49.87 
 
 		 349 aa  292  7e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0682209  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  50 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6150  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  45.15 
 
 		 409 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.274671  normal  0.61333 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  49.13 
 
 		 369 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  48.29 
 
 		 369 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  49.32 
 
 		 368 aa  248  9e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0467  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  45.74 
 
 		 385 aa  245  8e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  43.69 
 
 		 343 aa  229  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  45.18 
 
 		 360 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  42.59 
 
 		 335 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  45.82 
 
 		 328 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  43.7 
 
 		 340 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  43.54 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  42.13 
 
 		 352 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  42.14 
 
 		 389 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  42.56 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  45.35 
 
 		 396 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  42.7 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.42 
 
 		 352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  42.99 
 
 		 369 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  42.2 
 
 		 361 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  42.2 
 
 		 399 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  40.12 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  41.21 
 
 		 361 aa  177  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  38.99 
 
 		 386 aa  172  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  42.73 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25690  folate-binding protein YgfZ  36.45 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  28.4 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  30.58 
 
 		 325 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  30.82 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  28.97 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  29.29 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.47 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  28.17 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  25.95 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  28.4 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  25.21 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  28.03 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.12 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2199  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.22 
 
 		 339 aa  67  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.7 
 
 		 327 aa  67  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  29.3 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2098  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  27.39 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.438328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1904  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.14 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.195861  normal  0.523701 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  25.23 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  25.23 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1464  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.61 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.24907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  28.66 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0959  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.91 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3735  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.14 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0261257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.07 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  25.94 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.72 
 
 		 309 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  25.91 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1881  folate-binding protein YgfZ  27.59 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  27.44 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  28.21 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1164  folate-binding protein YgfZ  23.76 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602813  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.91 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2474  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.839994  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.27 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.99 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  28.28 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  27.62 
 
 		 364 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.95 
 
 		 293 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2255  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.333338  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1720  glycine cleavage system T protein  26.8 
 
 		 365 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.845128 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00606  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  40.7 
 
 		 268 aa  53.1  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0340  putative aminomethyl transferase  32.2 
 
 		 305 aa  52.8  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4821  folate-binding protein YgfZ  27.16 
 
 		 285 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  24.92 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1357  glycine cleavage T protein  27.78 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03546  aminomethyltransferase  23.62 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0376  hypothetical protein  31.67 
 
 		 267 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.482866  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  31.5 
 
 		 267 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.2 
 
 		 363 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0178  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.32 
 
 		 362 aa  50.8  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.146261 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03031  GcvT-like aminomethyltransferase  25.33 
 
 		 280 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.000485176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4019  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.72 
 
 		 293 aa  50.4  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3431  folate-binding protein YgfZ  27.01 
 
 		 326 aa  50.4  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1013  folate-binding protein YgfZ  23.88 
 
 		 284 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1190  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.85 
 
 		 360 aa  49.7  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  26.71 
 
 		 366 aa  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0712  folate-binding protein YgfZ  34.17 
 
 		 291 aa  49.7  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537236 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0500  glycine cleavage system T protein  25.21 
 
 		 371 aa  49.3  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1100  folate-binding protein YgfZ  35.35 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1737  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.84 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00179211  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3205  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.96 
 
 		 363 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000683742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.46 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0259  hypothetical protein  32.23 
 
 		 265 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1462  glycine cleavage system T protein aminomethyltransferase  31.11 
 
 		 279 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>