More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3469 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 		 375 aa  743    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1501  folate-binding protein YgfZ  73.44 
 
 		 384 aa  560  1e-158  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.119461  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  62.4 
 
 		 362 aa  460  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  59.42 
 
 		 386 aa  441  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  31.41 
 
 		 375 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  27.75 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  28.93 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  29.38 
 
 		 342 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  25.98 
 
 		 357 aa  110  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.62 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  27.91 
 
 		 364 aa  106  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.6 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  28.73 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.45 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  29.35 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4387  glycine cleavage system T protein  29.95 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.55 
 
 		 369 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  27.96 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.46 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.67 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1523  glycine cleavage system T protein  28.42 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  27.57 
 
 		 369 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.63 
 
 		 1003 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3003  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.72 
 
 		 372 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.265781 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  27.16 
 
 		 1003 aa  99.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.74 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  29.79 
 
 		 370 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.38 
 
 		 1003 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.38 
 
 		 1003 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.96 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.38 
 
 		 1003 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.38 
 
 		 1003 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  29.5 
 
 		 386 aa  97.4  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  27.65 
 
 		 889 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  27.65 
 
 		 1002 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  28.74 
 
 		 351 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  27.65 
 
 		 1002 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2759  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.07 
 
 		 363 aa  97.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.3 
 
 		 366 aa  97.1  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  27.65 
 
 		 1002 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.52 
 
 		 360 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.03 
 
 		 366 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  27.65 
 
 		 1002 aa  96.3  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  25.82 
 
 		 1028 aa  95.9  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  28.83 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.61 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  28.26 
 
 		 339 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.63 
 
 		 366 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.28 
 
 		 1003 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.03 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.03 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.98 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.03 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  25.63 
 
 		 1003 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.03 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  32.61 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4046  glycine cleavage system T protein  29.27 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00578846  normal  0.203925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6837  folate-binding protein YgfZ  31.56 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.44 
 
 		 352 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  29.49 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3617  glycine cleavage system T protein  27.51 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.76 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  25.07 
 
 		 356 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  26.88 
 
 		 366 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  25.07 
 
 		 356 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.96 
 
 		 359 aa  93.2  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.76 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  26.7 
 
 		 350 aa  92  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.76 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.38 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.49 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  30.11 
 
 		 352 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3371  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.38 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.577029  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1835  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.47 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4806  glycine cleavage system T protein  27.86 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0056  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.87 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3880  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.68 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.81 
 
 		 324 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  26.13 
 
 		 1000 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3357  glycine cleavage system T protein  30.2 
 
 		 372 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380294  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  26.13 
 
 		 1000 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.34 
 
 		 360 aa  90.5  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  27.73 
 
 		 371 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  27.19 
 
 		 344 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  28.5 
 
 		 365 aa  90.1  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.27 
 
 		 366 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  27.62 
 
 		 325 aa  89.7  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  25.57 
 
 		 999 aa  89.7  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  28.91 
 
 		 381 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3316  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.53 
 
 		 387 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0709071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3320  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.5 
 
 		 364 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.095795 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  27.07 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  27.79 
 
 		 440 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  27.79 
 
 		 442 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2939  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.54 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0289  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.63 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00965774  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.41 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0338  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.34 
 
 		 363 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0368876  normal  0.123109 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1269  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.46 
 
 		 400 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>