More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3692 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  100 
 
 		 267 aa  540  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.42 
 
 		 337 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.19 
 
 		 324 aa  119  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  27.69 
 
 		 322 aa  108  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  29.31 
 
 		 325 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  31.23 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  31.02 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  25.99 
 
 		 342 aa  97.1  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  31.11 
 
 		 304 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  31.11 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1117  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.54 
 
 		 293 aa  92.4  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.53 
 
 		 327 aa  89  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1256  folate-binding protein YgfZ  27.94 
 
 		 293 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4250  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.31 
 
 		 324 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0974011  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1238  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.67 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  25.72 
 
 		 327 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0655  folate-binding protein YgfZ  31.64 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0691  folate-binding protein YgfZ  30.51 
 
 		 276 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169246  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2873  hypothetical protein  29.81 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  24.18 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  39.53 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2860  folate-binding protein YgfZ  28.23 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  25.74 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  30.8 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2375  putative glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.02 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  28.97 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2704  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.28 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4019  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.34 
 
 		 293 aa  82  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24971  aminomethyltransferase GcvT-like protein  26.88 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0884  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.82 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233435  hitchhiker  0.00165742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1754  folate-binding protein YgfZ  31.58 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.53 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4331  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.38 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3471  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.31 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1416  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.7 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0480  folate-binding protein YgfZ  26.37 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4342  folate-binding protein YgfZ  28.86 
 
 		 340 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal  0.943713 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3028  folate-binding protein YgfZ  27.62 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0230  hypothetical protein  28.44 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8240  folate-binding protein YgfZ  30.5 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3099  folate-binding protein YgfZ  25.98 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.623052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2521  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.14 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0149913  hitchhiker  0.00318223 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1462  glycine cleavage system T protein aminomethyltransferase  27.88 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1100  folate-binding protein YgfZ  29.95 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.27 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0259  hypothetical protein  27.49 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1085  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.48 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000414438  hitchhiker  0.0000000121971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  32.26 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1985  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.01 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  31.85 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3008  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.37 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4360  folate-binding protein YgfZ  26.79 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689561  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0049  glycine cleavage system T protein  27.48 
 
 		 366 aa  68.9  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.866309  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  32.28 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0812  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.93 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000519539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4821  folate-binding protein YgfZ  30.58 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0712  folate-binding protein YgfZ  26.16 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.537236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4625  folate-binding protein YgfZ  39.52 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3414  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.08 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.215504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  39.83 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0444  folate-binding protein YgfZ  28.62 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.401201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2037  glycine cleavage system T protein  25.93 
 
 		 375 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0062  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.97 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03031  GcvT-like aminomethyltransferase  24.1 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  hitchhiker  0.000485176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5037  folate-binding protein YgfZ  28.81 
 
 		 369 aa  65.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4673  folate-binding protein YgfZ  28.75 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363501  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0959  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.13 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4304  folate-binding protein YgfZ  28.57 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  29.68 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2253  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.76 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2255  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.333338  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3987  folate-binding protein YgfZ  28.64 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.801907  decreased coverage  0.00101904 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0727  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.86 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639994  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1013  folate-binding protein YgfZ  25.45 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.834471 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  39.47 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0230  folate-binding protein YgfZ  25.36 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0660  folate-binding protein YgfZ  23.77 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.439221  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0667  aminomethyltransferase, putative  23.77 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  24.38 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  28.38 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2622  glycine cleavage T-protein barrel  23.61 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96003  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  32.41 
 
 		 440 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  32.41 
 
 		 442 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54480  hypothetical protein  24.32 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.812982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5709  folate-binding protein YgfZ  38.14 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  32.75 
 
 		 371 aa  62.4  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.69 
 
 		 752 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3086  folate-binding protein YgfZ  26.99 
 
 		 399 aa  62.4  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2682  aminomethyltransferase, glycine cleavage system T protein  35.11 
 
 		 361 aa  62.4  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122455  normal  0.82644 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17390  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  38.66 
 
 		 398 aa  62  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0748  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.66 
 
 		 316 aa  62  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.642058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2127  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25 
 
 		 298 aa  62  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  38.46 
 
 		 365 aa  62  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2092  hypothetical protein  26.94 
 
 		 261 aa  62  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29531  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.3 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04980  folate-binding protein YgfZ  38.89 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0047  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.24 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.21464  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0706  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.87 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.503998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00606  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  30 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2267  glycine cleavage T-protein (aminomethyl transferase)  22.96 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>