More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3450 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3450  glycine cleavage T-protein barrel  100 
 
 
327 aa  672    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0834766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3533  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.11 
 
 
337 aa  230  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3708  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  43.34 
 
 
324 aa  225  7e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0106413 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1254  folate-binding protein YgfZ  40.75 
 
 
322 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2547  folate-binding protein YgfZ  33.23 
 
 
325 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1651  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.08 
 
 
327 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.411538 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2871  folate-binding protein YgfZ  32.4 
 
 
326 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1989  folate-binding protein YgfZ  31.58 
 
 
354 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.15 
 
 
349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.77868  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0954  glycine cleavage T-protein-like  32.5 
 
 
344 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.436358  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0063  folate-binding protein YgfZ  28.17 
 
 
356 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0061  folate-binding protein YgfZ  28.17 
 
 
356 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000369449  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  27.22 
 
 
371 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4173  folate-binding protein YgfZ  31.85 
 
 
336 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2628  glycine cleavage T protein, aminomethyl transferase  28.79 
 
 
342 aa  96.7  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.509615  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3184  aminomethyltransferase  30.5 
 
 
372 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000207434  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  28.26 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  26.52 
 
 
364 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.69 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  25.91 
 
 
357 aa  90.9  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  25.25 
 
 
365 aa  89.4  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  27.11 
 
 
366 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2780  glycine cleavage T-protein barrel  27.8 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.369075  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  24.3 
 
 
365 aa  87  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0748  folate-binding protein YgfZ  28.71 
 
 
325 aa  87  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.485087  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.52 
 
 
368 aa  85.9  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.37 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4451  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.94 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.05 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.85 
 
 
360 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0855  folate-binding protein YgfZ  28.48 
 
 
339 aa  82  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.22028  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0266  folate-binding protein YgfZ  24.44 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  hitchhiker  0.0098053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3415  folate-binding protein YgfZ  30.77 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3692  folate-binding protein YgfZ  36.92 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0180331  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.22 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.22 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.32 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.15 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  22.52 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  25.69 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0376  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.81 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.53 
 
 
365 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.06 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  25.36 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03590  folate-binding protein YgfZ  28.66 
 
 
386 aa  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.663588 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 
799 aa  77  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2308  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.06 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.512156 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2848  LigA  35.57 
 
 
304 aa  76.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  25.6 
 
 
977 aa  76.3  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.94 
 
 
360 aa  76.3  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3469  folate-binding protein YgfZ  26.55 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.53 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3032  folate-binding protein YgfZ  37.4 
 
 
304 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.156046  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  25.68 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25 
 
 
362 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2938  folate-binding protein YgfZ  37.4 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.428228  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 
819 aa  75.1  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.12 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1587  glycine cleavage system T protein  26.76 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.5 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  26.58 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  28.36 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3371  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.5 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.577029  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.29 
 
 
359 aa  73.6  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  26.46 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  26.2 
 
 
365 aa  73.2  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.13 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  23.9 
 
 
442 aa  73.6  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37750  folate-binding protein YgfZ  28.06 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  23.9 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  26.98 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3617  glycine cleavage system T protein  26.28 
 
 
410 aa  72.8  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.987909  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0313  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.55 
 
 
369 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.84 
 
 
362 aa  72  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3320  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.18 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.095795 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  25.31 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  24.5 
 
 
825 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3310  FAD dependent oxidoreductase  24.68 
 
 
816 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198346  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.47 
 
 
403 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  26.91 
 
 
955 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0976  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.83 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.75 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1559  glycine cleavage system T protein  24.92 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1874  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.32 
 
 
993 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.05 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1269  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.99 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.1 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0515  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  27.98 
 
 
977 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2719  folate-binding protein YgfZ  30.1 
 
 
361 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239345 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0332  folate-binding protein YgfZ  25.15 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.97102  normal  0.0439096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  26.81 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  25.89 
 
 
816 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  25.8 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.33 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  23.12 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.55 
 
 
376 aa  69.3  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.73 
 
 
364 aa  69.3  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.13 
 
 
375 aa  69.3  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.73 
 
 
761 aa  69.3  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0919  LigA  26.51 
 
 
328 aa  69.3  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321522  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>