153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0592 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  712    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  41.39 
 
 
362 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  42.15 
 
 
365 aa  282  5.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  43.27 
 
 
395 aa  276  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  40.74 
 
 
393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  40.46 
 
 
388 aa  269  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  40.73 
 
 
410 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  42.44 
 
 
390 aa  269  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  41.91 
 
 
390 aa  269  7e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  41.38 
 
 
390 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  41.38 
 
 
390 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  41.38 
 
 
390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  40.87 
 
 
386 aa  264  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  41.64 
 
 
390 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  41.64 
 
 
390 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  41.38 
 
 
390 aa  260  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2974  hypothetical protein  41.99 
 
 
393 aa  259  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00544047  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  42.44 
 
 
387 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  42.52 
 
 
395 aa  256  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1016  SMC domain-containing protein  42.64 
 
 
386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0527217  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  44.44 
 
 
385 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  43.6 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  41.38 
 
 
387 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  41.11 
 
 
387 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  42.89 
 
 
390 aa  252  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1230  SMC domain protein  42.75 
 
 
386 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.086198 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  43.88 
 
 
388 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  42.52 
 
 
392 aa  248  9e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  42.86 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  40.9 
 
 
393 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  42.53 
 
 
436 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  42.53 
 
 
392 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  42.53 
 
 
436 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  42.53 
 
 
436 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  42.53 
 
 
392 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  42.53 
 
 
436 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  42.53 
 
 
392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  41.53 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  41.53 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  42.21 
 
 
385 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  38.8 
 
 
367 aa  229  8e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  42.33 
 
 
393 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4659  hypothetical protein  45.03 
 
 
385 aa  225  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  38.8 
 
 
410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  41.85 
 
 
388 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  43.62 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  41.49 
 
 
388 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  42.71 
 
 
392 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  43.35 
 
 
391 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  43.35 
 
 
391 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  43.09 
 
 
391 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  43.09 
 
 
391 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  42.82 
 
 
391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  42.44 
 
 
392 aa  212  9e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  41.28 
 
 
385 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  40.21 
 
 
390 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  40.21 
 
 
390 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  38.11 
 
 
382 aa  199  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  40.21 
 
 
390 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  40.9 
 
 
388 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  26.84 
 
 
378 aa  124  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  27.87 
 
 
368 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  29.91 
 
 
386 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  26.88 
 
 
362 aa  114  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  26.59 
 
 
377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  25.91 
 
 
378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  27.55 
 
 
395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  26.65 
 
 
378 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  23.5 
 
 
364 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  26.78 
 
 
382 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.78 
 
 
382 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  24.37 
 
 
370 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.72 
 
 
382 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  26.94 
 
 
370 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  26.67 
 
 
370 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  27.79 
 
 
364 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  25.86 
 
 
367 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  25.86 
 
 
367 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  24.72 
 
 
363 aa  97.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  24.2 
 
 
357 aa  95.1  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  24.93 
 
 
363 aa  94.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  27.48 
 
 
397 aa  94  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  26.32 
 
 
398 aa  94  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  27.32 
 
 
398 aa  93.6  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  24.78 
 
 
369 aa  91.3  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  24.66 
 
 
416 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  26.95 
 
 
399 aa  89.7  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  25.36 
 
 
373 aa  89.4  8e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  27.01 
 
 
369 aa  87.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2033  ATPase  24.64 
 
 
399 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  23.88 
 
 
365 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  25.39 
 
 
411 aa  84.3  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  25.84 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  27.98 
 
 
409 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  34.86 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  22.7 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  22.05 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  25.33 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  24.57 
 
 
394 aa  79.3  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  25.41 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>