3578 genes were found for organism Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 36    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Ccel_0001  CDS  NC_011898  27  1349  1323  chromosomal replication initiation protein  YP_002504369  decreased coverage  1.18947e-06  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0002  CDS  NC_011898  1598  2698  1101  DNA polymerase III subunit beta  YP_002504370  normal  0.039801  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0003  CDS  NC_011898  2726  2941  216  RNA-binding S4 domain protein  YP_002504371  normal  0.241542  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0004  CDS  NC_011898  2955  4073  1119  DNA replication and repair protein RecF  YP_002504372  normal  0.370076  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0005  CDS  NC_011898  4141  4410  270  hypothetical protein  YP_002504373  normal  0.675199  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0006  CDS  NC_011898  4442  6370  1929  DNA gyrase, B subunit  YP_002504374  normal  0.965796  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0007  CDS  NC_011898  6639  7412  774  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  YP_002504375  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0008  CDS  NC_011898  7418  8263  846  parB-like partition protein  YP_002504376  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0009  CDS  NC_011898  8426  8956  531  hypothetical protein  YP_002504377  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0010  CDS  NC_011898  9000  9761  762  TPR repeat-containing protein  YP_002504378  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0011  CDS  NC_011898  10403  10942  540  CDP-diacylglycerol/serine O-phosphatidyltransferase  YP_002504379  normal  0.94141  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0012  CDS  NC_011898  11177  11815  639  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  YP_002504380  normal  0.0912057  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0013  CDS  NC_011898  11880  12416  537  hypothetical protein  YP_002504381  normal  0.0432449  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0014  CDS  NC_011898  12496  12750  255  hypothetical protein  YP_002504382  normal  0.0219459  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0015  CDS  NC_011898  12880  13071  192  sigmaK-factor processing regulatory BofA  YP_002504383  hitchhiker  0.00476029  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0016  CDS  NC_011898  13334  16885  3552  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  YP_002504384  normal  0.0384233  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0017  CDS  NC_011898  17239  18222  984  spore coat protein, CotS family  YP_002504385  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0018  CDS  NC_011898  18289  19959  1671  formate-tetrahydrofolate ligase FTHFS  YP_002504386  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0019  CDS  NC_011898  20228  20431  204  hypothetical protein  YP_002504387  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0020  CDS  NC_011898  20580  20846  267  protein of unknown function DUF1021  YP_002504388  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0021  CDS  NC_011898  21120  22688  1569  Peptidoglycan-binding LysM  YP_002504389  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0022  CDS  NC_011898  22884  23735  852  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  YP_002504390  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0023  CDS  NC_011898  23752  24438  687  transcriptional regulator, GntR family  YP_002504391  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0024  CDS  NC_011898  24516  26117  1602  AAA ATPase central domain protein  YP_002504392  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0025  CDS  NC_011898  26265  26996  732  phage shock protein A, PspA  YP_002504393  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0026  CDS  NC_011898  27021  27515  495  GCN5-related N-acetyltransferase  YP_002504394  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0027  CDS  NC_011898  27546  28373  828  hypothetical protein  YP_002504395  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0028  CDS  NC_011898  28447  30024  1578  protein of unknown function DUF342  YP_002504396  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0029  CDS  NC_011898  30070  31995  1926  hypothetical protein  YP_002504397  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0030  CDS  NC_011898  32022  32426  405  holo-acyl-carrier-protein synthase  YP_002504398  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0031  CDS  NC_011898  32453  33592  1140  metallophosphoesterase  YP_002504399  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0032  CDS  NC_011898  33613  35607  1995  hypothetical protein  YP_002504400  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0033  CDS  NC_011898  35660  36586  927  NLP/P60 protein  YP_002504401  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0034  CDS  NC_011898  36592  37704  1113  Monogalactosyldiacylglycerol synthase  YP_002504402  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0035  CDS  NC_011898  37904  38599  696  spore cortex-lytic enzyme  YP_002504403  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0036  CDS  NC_011898  38615  40006  1392  germination protein YpeB  YP_002504404  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0037  CDS  NC_011898  40169  40603  435  transcriptional regulator, MarR family  YP_002504405  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0038  CDS  NC_011898  40629  41084  456  peptide deformylase  YP_002504406  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0039  CDS  NC_011898  41190  42203  1014  S-layer domain protein  YP_002504407  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0040  CDS  NC_011898  42369  43385  1017  Abortive infection protein  YP_002504408  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0041  CDS  NC_011898  43420  44433  1014  DNA replication protein DnaC  YP_002504409  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0042  CDS  NC_011898  44466  45452  987  primosome, DnaD subunit  YP_002504410  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0043  CDS  NC_011898  45662  46177  516  Ferritin Dps family protein  YP_002504411  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0044  CDS  NC_011898  46249  47865  1617  extracellular solute-binding protein family 5  YP_002504412  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0045  CDS  NC_011898  48051  49049  999  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_002504413  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0046  CDS  NC_011898  49039  50049  1011  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  YP_002504414  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0047  CDS  NC_011898  50186  51181  996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002504415  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0048  CDS  NC_011898  51198  52121  924  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  YP_002504416  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0049  CDS  NC_011898  52670  54397  1728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  YP_002504417  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0050  CDS  NC_011898  55000  55911  912  diacylglycerol kinase catalytic region  YP_002504418  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0051  CDS  NC_011898  55929  57095  1167  nuclease SbcCD, D subunit  YP_002504419  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0052  CDS  NC_011898  57092  60241  3150  SMC domain protein  YP_002504420  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0053  CDS  NC_011898  60279  62507  2229  1,4-alpha-glucan branching enzyme  YP_002504421  normal  0.0344154  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0054  CDS  NC_011898  62580  63638  1059  periplasmic sugar-binding protein  YP_002504422  decreased coverage  3.50797e-05  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0055  CDS  NC_011898  63997  64281  285  ribosomal protein S6  YP_002504423  decreased coverage  5.48177e-06  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0056  CDS  NC_011898  64293  64721  429  single-strand binding protein  YP_002504424  hitchhiker  2.53861e-06  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0057  CDS  NC_011898  65010  65303  294  30S ribosomal protein S18  YP_002504425  hitchhiker  0.000101407  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0058  CDS  NC_011898  65420  65758  339  transcriptional regulator, XRE family  YP_002504426  normal  0.0711688  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0059  CDS  NC_011898  66103  66315  213  hypothetical protein  YP_002504427  normal  0.233485  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0060  CDS  NC_011898  66526  66897  372  hypothetical protein  YP_002504428  normal  0.421044  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0061  CDS  NC_011898  67215  67685  471  transposase IS200-family protein  YP_002504429  normal  0.0604779  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0062  CDS  NC_011898  68141  69136  996  hydrolase (metallo-beta-lactamase superfamily)-like protein  YP_002504430  normal  0.447894  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0063  CDS  NC_011898  69576  70424  849  hypothetical protein  YP_002504431  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0064  CDS  NC_011898  70435  70953  519  hypothetical protein  YP_002504432  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0065  CDS  NC_011898  70967  73924  2958  SMC domain protein  YP_002504433  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0066  CDS  NC_011898  74147  77449  3303  type III restriction protein res subunit  YP_002504434  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0067  CDS  NC_011898  77670  78827  1158  integrase family protein  YP_002504435  normal  0.952097  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0068  CDS  NC_011898  78824  80209  1386  integrase family protein  YP_002504436  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0069  CDS  NC_011898  80200  81753  1554  integrase family protein  YP_002504437  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0070  CDS  NC_011898  81750  82196  447  hypothetical protein  YP_002504438  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0071  CDS  NC_011898  82681  84462  1782  SEC-C motif domain protein  YP_002504439  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0072  CDS  NC_011898  84739  87255  2517  hypothetical protein  YP_002504440  normal  0.661071  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0073  CDS  NC_011898  87609  88196  588  hypothetical protein  YP_002504441  hitchhiker  0.00543829  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0074  CDS  NC_011898  88905  89834  930  hypothetical protein  YP_002504442  decreased coverage  7.0418e-07  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0075  CDS  NC_011898  90250  90540  291  30S ribosomal protein S18  YP_002504443  hitchhiker  1.52962e-06  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0076  CDS  NC_011898  90746  91423  678  hypothetical protein  YP_002504444  hitchhiker  0.000425303  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0077  CDS  NC_011898  91604  91918  315  hypothetical protein  YP_002504445  hitchhiker  0.0022857  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0078  CDS  NC_011898  92021  92863  843  prephenate dehydratase  YP_002504446  normal  0.0545378  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0079  CDS  NC_011898  92956  93300  345  hypothetical protein  YP_002504447  normal  0.463203  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0080  CDS  NC_011898  93316  95319  2004  phosphoesterase RecJ domain protein  YP_002504448  normal  0.609068  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0081  CDS  NC_011898  95349  95795  447  50S ribosomal protein L9  YP_002504449  normal  0.957353  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0082  CDS  NC_011898  95838  97178  1341  replicative DNA helicase  YP_002504450  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0083  CDS  NC_011898  97179  98624  1446  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  YP_002504451  normal  0.24629  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0084  CDS  NC_011898  98660  99199  540  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  YP_002504452  normal  0.0216938  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0085  CDS  NC_011898  99447  101306  1860  ATP-dependent metalloprotease FtsH  YP_002504453  normal  0.0128077  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0086  CDS  NC_011898  101392  101784  393  hypothetical protein  YP_002504454  hitchhiker  0.000193039  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0087  CDS  NC_011898  102061  103251  1191  S-adenosylmethionine synthetase  YP_002504455  decreased coverage  2.21578e-06  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0088  CDS  NC_011898  103403  103741  339  hypothetical protein  YP_002504456  hitchhiker  0.00675009  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0089  CDS  NC_011898  103985  106426  2442  exonuclease V subunit alpha  YP_002504457  normal  0.930068  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0090  CDS  NC_011898  106584  107246  663  phosphoribosyltransferase  YP_002504458  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0091  CDS  NC_011898  107296  107709  414  regulatory protein, MerR  YP_002504459  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0092  CDS  NC_011898  107897  108184  288  Anti-sigma-28 factor FlgM family protein  YP_002504460  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0093  CDS  NC_011898  108231  108731  501  FlgN family protein  YP_002504461  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0094  CDS  NC_011898  108765  110891  2127  flagellar hook-associated protein FlgK  YP_002504462  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0095  CDS  NC_011898  110923  112536  1614  flagellar hook-associated protein FlgK  YP_002504463  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0096  CDS  NC_011898  112539  113468  930  flagellar hook-associated protein FlgL  YP_002504464  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0097  CDS  NC_011898  113503  114084  582  hypothetical protein  YP_002504465  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0098  CDS  NC_011898  114168  114614  447  flagellar assembly protein FliW  YP_002504466  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0099  CDS  NC_011898  114616  114834  219  carbon storage regulator, CsrA  YP_002504467  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Ccel_0100  CDS  NC_011898  115020  115841  822  flagellin domain protein  YP_002504468  normal  n/a    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 36    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>