183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0043 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0043  Ferritin Dps family protein  100 
 
 
171 aa  352  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1983  Ferritin Dps family protein  54.49 
 
 
172 aa  191  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0282013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0668  Ferritin, Dps family protein  52.38 
 
 
173 aa  185  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000253889  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0183  Ferroxidase  52.35 
 
 
171 aa  185  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000415099 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1199  ferroxidase  51.48 
 
 
169 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0733743  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1580  Ferroxidase  47.83 
 
 
161 aa  174  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0879  Ferroxidase  49.7 
 
 
171 aa  171  5e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000223127  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2466  Ferroxidase  49.4 
 
 
168 aa  169  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00000323257  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0514  Ferroxidase  47.62 
 
 
171 aa  167  8e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0298672  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1120  Ferritin and Dps  48.19 
 
 
176 aa  166  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1236  ferritin family protein  50.6 
 
 
170 aa  166  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000720561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1047  ferritin family protein  50.6 
 
 
170 aa  164  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000219081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1700  Ferroxidase  50.6 
 
 
172 aa  163  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000548628 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2555  cytoplasmic ferritin (an iron storage protein)  46.2 
 
 
174 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000856866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5211  ferritin  51.5 
 
 
168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000025071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0046  ferritin  51.5 
 
 
168 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.9165399999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5201  ferritin  51.5 
 
 
168 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000941544  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0556  Ferroxidase  47.2 
 
 
164 aa  161  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.729145 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1570  Ferritin Dps family protein  48.5 
 
 
170 aa  161  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5196  ferritin  51.5 
 
 
168 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00124859  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4919  ferritin  51.5 
 
 
168 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4764  ferritin  51.5 
 
 
168 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000763521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5296  ferritin  51.5 
 
 
168 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123556  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0118  Ferritin, Dps family protein  47.34 
 
 
172 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.38357  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5164  ferritin  51.5 
 
 
168 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.57868e-47 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2519  Ferritin Dps family protein  49.4 
 
 
172 aa  160  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00323772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4783  ferritin  51.2 
 
 
168 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31249  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1565  Ferritin, Dps family protein  51.81 
 
 
169 aa  159  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4880  Ferritin Dps family protein  50.9 
 
 
168 aa  159  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00199979  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0328  ferroxidase  44.24 
 
 
170 aa  159  2e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.962185  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3808  Ferroxidase  46.3 
 
 
166 aa  156  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.057799  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1965  Ferritin, Dps family protein  45.03 
 
 
177 aa  154  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3795  Ferritin Dps family protein  45.68 
 
 
164 aa  154  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0794  Ferritin, Dps family protein  47.2 
 
 
162 aa  153  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.413552  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0827  ferritin  51.55 
 
 
164 aa  152  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3287  ferroxidase  42.77 
 
 
167 aa  149  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2683  Ferritin Dps family protein  46.67 
 
 
168 aa  149  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000192038  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0407  Ferritin Dps family protein  45.06 
 
 
175 aa  148  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.179307  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1791  ferritin  47.31 
 
 
186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000512633  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1381  ferroxidase  45.34 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000220076  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1307  ferritin  43.2 
 
 
173 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.757359  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0044  Ferritin and Dps  47.31 
 
 
175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.311572 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1697  Ferritin, Dps family protein  42.11 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265061  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0596  Ferritin, Dps family protein  40.99 
 
 
164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1855  ferroxidase  42.14 
 
 
167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.185397  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0479  Ferritin Dps family protein  43.31 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.918864  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1683  ferroxidase  45.34 
 
 
163 aa  145  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0136  ferroxidase  46.25 
 
 
163 aa  145  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2915  Ferritin Dps family protein  43.56 
 
 
172 aa  144  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0940  Ferritin Dps family protein  42.24 
 
 
162 aa  142  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0847106  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2910  ferroxidase  48.81 
 
 
171 aa  142  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00246323  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1617  ferroxidase  45.34 
 
 
163 aa  142  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2222  Ferritin Dps family protein  42.86 
 
 
176 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000624545  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1703  Ferroxidase  46.63 
 
 
164 aa  141  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.428586  hitchhiker  0.0000000000044787 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1512  Ferritin Dps family protein  43.12 
 
 
175 aa  141  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4070  Ferroxidase  42.33 
 
 
163 aa  141  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000582999  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0617  Ferritin Dps family protein  42.24 
 
 
165 aa  140  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.433385 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0428  Ferritin, Dps family protein  41.88 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1417  Ferritin, Dps family protein  46.71 
 
 
477 aa  136  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.672338  normal  0.285216 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2418  Ferritin Dps family protein  40.37 
 
 
165 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.47265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2260  Ferritin Dps family protein  43.11 
 
 
170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1860  Ferritin Dps family protein  42.24 
 
 
164 aa  132  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00316362  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0804  ferritin  41.29 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0449  ferritin, putative  41.25 
 
 
160 aa  128  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000133256  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01880  ferritin-like protein  39.62 
 
 
171 aa  127  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0715  nonheme iron-containing ferritin  41.29 
 
 
167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0641  nonheme iron-containing ferritin  41.29 
 
 
167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1058  nonheme iron-containing ferritin  41.29 
 
 
167 aa  124  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2778  Ferritin and Dps  42.95 
 
 
168 aa  123  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001945  ferritin-like protein 2  35.43 
 
 
175 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2947  ferritin-1  34.52 
 
 
175 aa  121  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4766  ferroxidase  37.74 
 
 
175 aa  120  9e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.266112  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0132  Ferritin, Dps family protein  38.36 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2437  ferritin  36.78 
 
 
181 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0129  ferroxidase  37.74 
 
 
175 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0139  ferritin  37.74 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0866  ferroxidase  35.71 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761126  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0042  Ferritin, Dps family protein  36.48 
 
 
174 aa  118  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.97905  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00534  ferritin  34.86 
 
 
175 aa  118  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0133  Ferritin, Dps family protein  37.11 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0127  Ferritin, Dps family protein  37.11 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.111541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0132  Ferritin, Dps family protein  37.11 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4222  ferroxidase  37.11 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0136  Ferroxidase  37.11 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0132  ferroxidase  37.11 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4374  ferroxidase  36.48 
 
 
175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0134844  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0137  ferroxidase  37.11 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0142  ferritin 1  35.71 
 
 
175 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0921  ferritin like protein 2  37.04 
 
 
165 aa  114  7.999999999999999e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.454183  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0141  ferritin  35.22 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1942  ferroxidase  37.97 
 
 
172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295968 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1921  Ferroxidase  35.85 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0301  Ferritin Dps family protein  37.58 
 
 
171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.384105 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1947  Ferritin, Dps family protein  39.26 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1981  Ferritin Dps family protein  39.26 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1838  Ferroxidase  35.71 
 
 
168 aa  111  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1278  ferritin  35.62 
 
 
165 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000511035  hitchhiker  0.0000116181 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1738  Ferroxidase  35.62 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146321  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2644  ferritin  35.62 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000490475 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01862  hypothetical protein  35.62 
 
 
165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00715536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>