More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0041 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0041  DNA replication protein DnaC  100 
 
 		 337 aa  687    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2418  DNA replication protein DnaC  52.51 
 
 		 347 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.132459  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  38.58 
 
 		 327 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2046  DNA replication protein DnaC  32.25 
 
 		 345 aa  166  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000831596  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0105  DNA replication protein DnaC  36.56 
 
 		 334 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2940  DNA replication protein DnaC  32.63 
 
 		 331 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.443717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2623  DNA replication protein DnaC  32.63 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  32.41 
 
 		 319 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  26.98 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  28.51 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  29.88 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  26.75 
 
 		 245 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  28.14 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  25.68 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  32.88 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  28.46 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3484  IstB ATP binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3400  IstB ATP binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0282  IstB ATP binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624966  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2302  IstB ATP binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4397  IstB ATP binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.101635  normal  0.403377 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4289  IstB ATP binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.991819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4787  IstB ATP binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  34.75 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  34.75 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1939  IstB-like ATP-binding protein  26.18 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149636  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3288  IstB ATP binding domain-containing protein  28.1 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  25.54 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  34.97 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  34.97 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5453  IstB ATP binding domain-containing protein  27.74 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0707  IstB ATP binding domain-containing protein  28.39 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.164792  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0135  IstB domain protein ATP-binding protein  26.6 
 
 		 245 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1462  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  29.94 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.844305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1477  putative insertion sequence ATP-binding protein y4pL  29.94 
 
 		 247 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1364  IstB domain protein ATP-binding protein  26.6 
 
 		 245 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06962  hypothetical protein  28.29 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  25.15 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01936  hypothetical protein  28.29 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06056  hypothetical protein  28.29 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02341  hypothetical protein  28.29 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00183  transposase  28.29 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  25.15 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9836  transposase  28.76 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1373  transposition helper protein  26.06 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0960565  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6259  IstB-like ATP-binding protein  25.17 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  27.27 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  27.27 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  27.27 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  27.27 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5412  IstB ATP binding domain-containing protein  27.1 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.687138 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1555  IstB ATP binding domain-containing protein  27.33 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2054  IstB ATP binding domain-containing protein  27.33 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3415  IstB ATP binding domain-containing protein  27.33 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.237509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1216  IstB ATP binding domain-containing protein  26.62 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.814777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  31.97 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  26.19 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  23.6 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1854  IstB ATP binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0848182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1733  IstB ATP binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0984336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  32.26 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12190  DNA replication protein  28.99 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.748018  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3593  IstB ATP binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6464  IstB ATP binding domain-containing protein  28.67 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.390646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4731  IstB ATP binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5629  IstB ATP binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5782  IstB ATP binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6207  IstB ATP binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2290  IstB ATP binding domain-containing protein  25.66 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  27.49 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4797  IstB ATP binding domain-containing protein  25.66 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0613  IstB ATP binding domain-containing protein  26.49 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.328728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  26.03 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  26.57 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  23.4 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0998  IstB ATP binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1794  putative transposase-related ATP-binding subunit  25.66 
 
 		 249 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5655  IstB domain protein ATP-binding protein  27.15 
 
 		 247 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4228  IstB ATP binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 251 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0192  IstB ATP binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 251 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0411  IstB ATP binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 251 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0597  IstB ATP binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 251 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3179  IstB ATP binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 251 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1629  IstB ATP binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 251 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1853  IstB ATP binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 251 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.262764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2255  IstB ATP binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 251 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2397  IstB ATP binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 251 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0127781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2981  IstB ATP binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0623611  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  26.03 
 
 		 469 aa  56.2  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3437  IstB ATP binding domain-containing protein  32.99 
 
 		 259 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370706 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3715  IstB domain protein ATP-binding protein  26.45 
 
 		 253 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.0923789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2842  ISPsy14, transposition helper protein  28.1 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00133865  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0009  IstB ATP binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0274  IstB ATP binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0329  IstB ATP binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.627397  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0643  IstB ATP binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1137  IstB ATP binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1280  IstB ATP binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.601601  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1347  IstB ATP binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.917439  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1451  IstB ATP binding domain-containing protein  29.61 
 
 		 278 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.531328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>