38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0086 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0086  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  261  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000193039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2252  thioesterase superfamily protein  55.81 
 
 
134 aa  150  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0128  hypothetical protein  56.59 
 
 
129 aa  150  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000227024  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3066  thioesterase superfamily protein  53.17 
 
 
131 aa  144  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.22535e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2209  thioesterase superfamily protein  52.76 
 
 
132 aa  134  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000185786  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1839  Thioesterase superfamily  53.64 
 
 
123 aa  122  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.696414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3560  hypothetical protein  48.84 
 
 
136 aa  113  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.492346  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3982  hypothetical protein  43.18 
 
 
137 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1847  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 
130 aa  104  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0080  hypothetical protein  45.19 
 
 
139 aa  100  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0696  dihydrolipoamide acyltransferase  46.67 
 
 
128 aa  100  7e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3802  hypothetical protein  38.93 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.474484  hitchhiker  0.000140852 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0155  thioesterase superfamily protein  39.23 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2467  hypothetical protein  36.8 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2916  thioesterase superfamily protein  37.6 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154067  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5923  thioesterase superfamily protein  38.58 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.036781  normal  0.299905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3050  hypothetical protein  37.5 
 
 
134 aa  94  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97623  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7731  thioesterase superfamily protein  41.44 
 
 
129 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3033  thioesterase superfamily protein  38.14 
 
 
152 aa  90.1  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3259  thioesterase superfamily protein  36.44 
 
 
131 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1742  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.117615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3233  hypothetical protein  44.44 
 
 
142 aa  87.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8316  hypothetical protein  33.06 
 
 
130 aa  87  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1520  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
133 aa  80.1  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0552  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000347456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1187  hypothetical protein  30.58 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.238156 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2310  conserved hypothetical protein  40.91 
 
 
89 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2969  thioesterase  29.37 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1291  hypothetical protein  29.75 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1708  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850113  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0734  thioesterase superfamily protein  36.73 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254305  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1367  hypothetical protein  28.93 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.412504  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3182  hypothetical protein  30.77 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231054  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0813  hypothetical protein  27.05 
 
 
130 aa  58.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.823237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1506  thioesterase  27.2 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0703562  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2323  hypothetical protein  30 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.920288 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1320  thioesterase  29 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.262542 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2156  thioesterase-like protein  26.67 
 
 
139 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>