More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0087 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0445  S-adenosylmethionine synthetase  76.14 
 
 		 395 aa  642    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000309499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0087  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 		 396 aa  813    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000221578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  82.99 
 
 		 397 aa  697    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0686  S-adenosylmethionine synthetase  77.55 
 
 		 396 aa  641    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3891  S-adenosylmethionine synthetase  75.51 
 
 		 396 aa  641    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00109689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  74.3 
 
 		 403 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  73.28 
 
 		 403 aa  618  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  73.72 
 
 		 395 aa  615  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3096  methionine adenosyltransferase  73.99 
 
 		 397 aa  615  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  73.18 
 
 		 399 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  73.18 
 
 		 399 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  73.18 
 
 		 399 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  73.18 
 
 		 399 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  72.93 
 
 		 399 aa  609  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  72.93 
 
 		 399 aa  610  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0363  S-adenosylmethionine synthetase  72.93 
 
 		 399 aa  608  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000052915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  72.93 
 
 		 399 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  72.93 
 
 		 399 aa  609  1e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  72.68 
 
 		 399 aa  607  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4594  S-adenosylmethionine synthetase  72.18 
 
 		 399 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.791965  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3874  methionine adenosyltransferase  71.43 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000696498  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1234  S-adenosylmethionine synthetase  71.72 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0170314  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2435  S-adenosylmethionine synthetase  74.62 
 
 		 391 aa  595  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2145  S-adenosylmethionine synthetase  74.62 
 
 		 391 aa  595  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2330  methionine adenosyltransferase  68.69 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3981  S-adenosylmethionine synthetase  70.2 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000348916  hitchhiker  0.00000146833 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  70.05 
 
 		 393 aa  585  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0894  S-adenosylmethionine synthetase  69.19 
 
 		 395 aa  581  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000969915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  69.31 
 
 		 395 aa  572  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  68.29 
 
 		 398 aa  566  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  68.29 
 
 		 398 aa  566  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09860  Methionine adenosyltransferase  68.37 
 
 		 402 aa  567  1e-160  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1171  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 		 395 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000972386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1133  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 		 395 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000111198  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0160  S-adenosylmethionine synthetase  66.92 
 
 		 405 aa  560  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.754463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1352  S-adenosylmethionine synthetase  67.77 
 
 		 399 aa  557  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0489  S-adenosylmethionine synthetase  66.92 
 
 		 405 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2353  S-adenosylmethionine synthetase  65.9 
 
 		 405 aa  551  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1186  S-adenosylmethionine synthetase  67 
 
 		 414 aa  549  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0660  S-adenosylmethionine synthetase  66.33 
 
 		 402 aa  548  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000409512  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0831  S-adenosylmethionine synthetase  67.44 
 
 		 398 aa  546  1e-154  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3565  S-adenosylmethionine synthetase  66.84 
 
 		 403 aa  545  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814506  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1756  S-adenosylmethionine synthetase  66.58 
 
 		 395 aa  543  1e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000785421  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0125  S-adenosylmethionine synthetase  64.56 
 
 		 396 aa  541  1e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00105717  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1135  S-adenosylmethionine synthetase  66.67 
 
 		 397 aa  541  1e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0512  S-adenosylmethionine synthetase  64.87 
 
 		 406 aa  538  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.128804  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_453  S-adenosylmethionine synthetase  64.36 
 
 		 406 aa  535  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00689475  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0456  S-adenosylmethionine synthetase  65.98 
 
 		 402 aa  536  1e-151  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000025014  normal  0.132712 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0488  S-adenosylmethionine synthetase  64.62 
 
 		 406 aa  536  1e-151  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.227197  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3549  S-adenosylmethionine synthetase  65.82 
 
 		 403 aa  534  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.642541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3661  S-adenosylmethionine synthetase  67.94 
 
 		 393 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.284553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0533  S-adenosylmethionine synthetase  62.85 
 
 		 393 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000146797  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1725  S-adenosylmethionine synthetase  62.82 
 
 		 402 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.710096  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1383  methionine adenosyltransferase  63.18 
 
 		 401 aa  525  1e-148  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1928  S-adenosylmethionine synthetase  64.9 
 
 		 389 aa  527  1e-148  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.10598e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3116  S-adenosylmethionine synthetase  64.38 
 
 		 391 aa  525  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1470  S-adenosylmethionine synthetase  67.43 
 
 		 412 aa  526  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274097  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2642  S-adenosylmethionine synthetase  64.1 
 
 		 391 aa  522  1e-147  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1857  S-adenosylmethionine synthetase  63.66 
 
 		 399 aa  521  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1864  S-adenosylmethionine synthetase  63.16 
 
 		 399 aa  521  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3161  S-adenosylmethionine synthetase  64.63 
 
 		 396 aa  521  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153387  hitchhiker  0.00000474907 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1306  S-adenosylmethionine synthetase  63.83 
 
 		 421 aa  520  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.883498  normal  0.454571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3729  S-adenosylmethionine synthetase  63.33 
 
 		 408 aa  518  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582078  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1290  S-adenosylmethionine synthetase  64.18 
 
 		 417 aa  521  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.134908  normal  0.0680854 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1718  S-adenosylmethionine synthetase  63.19 
 
 		 400 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388889  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1692  S-adenosylmethionine synthetase  63.61 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.753186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1716  S-adenosylmethionine synthetase  63.52 
 
 		 398 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123594  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3004  S-adenosylmethionine synthetase  63.32 
 
 		 397 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000578039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2818  Methionine adenosyltransferase  64.32 
 
 		 395 aa  515  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  63.1 
 
 		 387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1296  S-adenosylmethionine synthetase  64.72 
 
 		 395 aa  515  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0081249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  64.81 
 
 		 388 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  64.89 
 
 		 388 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03161  S-adenosylmethionine synthetase  63.17 
 
 		 381 aa  514  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.713354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2943  S-adenosylmethionine synthetase  64.48 
 
 		 389 aa  511  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3346  S-adenosylmethionine synthetase  62.06 
 
 		 384 aa  511  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.274047  decreased coverage  0.00210424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3192  S-adenosylmethionine synthetase  62.44 
 
 		 398 aa  511  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000568371  normal  0.539174 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5342  S-adenosylmethionine synthetase  62.28 
 
 		 399 aa  511  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339579  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1341  S-adenosylmethionine synthetase  64.48 
 
 		 389 aa  511  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000125757  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02772  S-adenosylmethionine synthetase  61.56 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  61.56 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1880  S-adenosylmethionine synthetase  63.73 
 
 		 387 aa  509  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000337587  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3336  S-adenosylmethionine synthetase  61.56 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.216224  normal  0.254076 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3263  S-adenosylmethionine synthetase  61.56 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0673019  normal  0.240242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3252  S-adenosylmethionine synthetase  61.31 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0015174  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02735  hypothetical protein  61.56 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  61.56 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3094  S-adenosylmethionine synthetase  62.97 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0289909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  61.56 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  60.97 
 
 		 388 aa  510  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3328  S-adenosylmethionine synthetase  61.56 
 
 		 384 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.196348  normal  0.570149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  63.48 
 
 		 389 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3084  S-adenosylmethionine synthetase  61.56 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.383726  hitchhiker  0.000161028 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  65.24 
 
 		 389 aa  508  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  62.76 
 
 		 390 aa  510  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4244  S-adenosylmethionine synthetase  61.56 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.908743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  61.87 
 
 		 383 aa  508  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0772  S-adenosylmethionine synthetase  61.56 
 
 		 384 aa  509  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0501612  hitchhiker  0.00139149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1363  S-adenosylmethionine synthetase  61.56 
 
 		 395 aa  508  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176558  normal  0.04012 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2760  S-adenosylmethionine synthetase  62.63 
 
 		 383 aa  508  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>