2497 genes were found for organism Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>   


Locus tag

Gene type

Replicon accession

From

To

Strand

Gene Length

Product

Protein accession

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Organism name

Kingdom

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
Mbur_0001  CDS  NC_007955  379  1392  1014  50S ribosomal protein L3P  YP_564775  normal  0.0115454  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0002  CDS  NC_007955  1398  2159  762  50S ribosomal protein L4P  YP_564776  hitchhiker  3.96442e-06  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0003  CDS  NC_007955  2156  2404  249  50S ribosomal protein L23P  YP_564777  hitchhiker  3.37619e-08  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0004  CDS  NC_007955  2416  3129  714  50S ribosomal protein L2P  YP_564778  unclonable  4.54303e-15  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
 
Mbur_0005  CDS  NC_007955  3146  3559  414  30S ribosomal protein S19P  YP_564779  unclonable  1.96004e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0006  CDS  NC_007955  3570  4025  456  50S ribosomal protein L22P  YP_564780  hitchhiker  1.8702e-13  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0007  CDS  NC_007955  4025  4939  915  30S ribosomal protein S3P  YP_564781  hitchhiker  4.52289e-09  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0008  CDS  NC_007955  4942  5145  204  50S ribosomal protein L29P  YP_564782  hitchhiker  2.0631e-11  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0009  CDS  NC_007955  5147  5452  306  ribonuclease P protein component 1  YP_564783  hitchhiker  4.69869e-11  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0010  CDS  NC_007955  5458  5787  330  30S ribosomal protein S17P  YP_564784  hitchhiker  3.32515e-10  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0011  CDS  NC_007955  5784  6182  399  50S ribosomal protein L14P  YP_564785  hitchhiker  7.40699e-10  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0012  CDS  NC_007955  6193  6546  354  50S ribosomal protein L24P  YP_564786  hitchhiker  1.12293e-10  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0013  CDS  NC_007955  6551  7261  711  30S ribosomal protein S4e  YP_564787  hitchhiker  2.6774e-10  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0014  CDS  NC_007955  7254  7763  510  50S ribosomal protein L5P  YP_564788  unclonable  5.43993e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0015  CDS  NC_007955  7763  7915  153  30S ribosomal protein S14P  YP_564789  unclonable  1.67188e-17  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0016  CDS  NC_007955  7927  8319  393  30S ribosomal protein S8P  YP_564790  unclonable  1.66957e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0017  CDS  NC_007955  8338  8871  534  50S ribosomal protein L6P  YP_564791  unclonable  4.87132e-16  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0018  CDS  NC_007955  8896  9342  447  50S ribosomal protein L32e  YP_564792  hitchhiker  1.44632e-13  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0019  CDS  NC_007955  9344  9790  447  50S ribosomal protein L19e  YP_564793  hitchhiker  1.68936e-11  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0020  CDS  NC_007955  9850  10371  522  50S ribosomal protein L18P  YP_564794  hitchhiker  1.51629e-09  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0021  CDS  NC_007955  10384  11019  636  30S ribosomal protein S5P  YP_564795  hitchhiker  3.2462e-07  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0022  CDS  NC_007955  11022  11483  462  50S ribosomal protein L30P  YP_564796  hitchhiker  8.1539e-08  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0023  CDS  NC_007955  11488  11931  444  50S ribosomal protein L15P  YP_564797  hitchhiker  2.0439e-05  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0024  CDS  NC_007955  12037  13515  1479  preprotein translocase subunit SecY  YP_564798  hitchhiker  0.00318334  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0025  CDS  NC_007955  13537  14184  648  adenylate kinase  YP_564799  hitchhiker  6.10793e-07  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0026  CDS  NC_007955  14204  14824  621  hypothetical protein  YP_564800  decreased coverage  1.32729e-07  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0027  CDS  NC_007955  14827  15354  528  cytidylate kinase  YP_564801  decreased coverage  3.01148e-09  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0028  CDS  NC_007955  15375  16370  996  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  YP_564802  hitchhiker  0.000488795  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0029  CDS  NC_007955  16763  17281  519  death-on-curing protein  YP_564803  normal  0.843806  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0030  CDS  NC_007955  17872  19089  1218  hypothetical protein  YP_564804  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0031  CDS  NC_007955  19141  19665  525  ThiJ/PfpI  YP_564805  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0032  CDS  NC_007955  19828  22650  2823  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  YP_564806  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0033  CDS  NC_007955  22656  23321  666  HAD family hydrolase  YP_564807  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0034  CDS  NC_007955  23343  23609  267  hypothetical protein  YP_564808  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0035  CDS  NC_007955  23792  24694  903  hypothetical protein  YP_564809  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0036  CDS  NC_007955  25003  25449  447  30S ribosomal protein S13P  YP_564810  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0037  CDS  NC_007955  25462  26016  555  30S ribosomal protein S4P  YP_564811  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0038  CDS  NC_007955  26030  26410  381  30S ribosomal protein S11P  YP_564812  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0039  CDS  NC_007955  26434  27237  804  DNA-directed RNA polymerase subunit D  YP_564813  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0040    NC_007955  27941  28288  348      normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0041  CDS  NC_007955  28589  29440  852  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  YP_564814  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0042  CDS  NC_007955  29584  29895  312  hypothetical protein  YP_564815  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0043  CDS  NC_007955  30002  31048  1047  radical SAM family Fe-S protein  YP_564816  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0044  CDS  NC_007955  31124  31315  192  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  YP_564817  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0045    NC_007955  31351  32972  1622      normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0046  CDS  NC_007955  32951  33286  336  hypothetical protein  YP_564818  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0047  CDS  NC_007955  33307  34851  1545  type II secretion system protein E  YP_564819  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0048  CDS  NC_007955  35190  35618  429  hypothetical protein  YP_564820  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0049  CDS  NC_007955  35836  37266  1431  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  YP_564821  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0050  CDS  NC_007955  37648  37890  243  hypothetical protein  YP_564822  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0051  CDS  NC_007955  38209  38661  453  N-acetylglutamate synthase  YP_564823  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0052  CDS  NC_007955  38736  39665  930  hypothetical protein  YP_564824  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0053  CDS  NC_007955  39784  40095  312  hypothetical protein  YP_564825  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0054  CDS  NC_007955  40108  41061  954  GTP cyclohydrolase  YP_564826  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0055  CDS  NC_007955  41365  41661  297  nucleoid protein MC1  YP_564827  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0056  CDS  NC_007955  41796  42710  915  acetylglutamate kinase  YP_564828  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0057  CDS  NC_007955  42736  43779  1044  hypothetical protein  YP_564829  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0058  CDS  NC_007955  43780  44694  915  GMP synthase subunit B  YP_564830  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0059  CDS  NC_007955  45035  46369  1335  hypothetical protein  YP_564831  normal  0.291896  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0060  CDS  NC_007955  46778  48184  1407  hypothetical protein  YP_564832  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0061  CDS  NC_007955  48323  50266  1944  ATP-dependent DNA helicase RecQ  YP_564833  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0062  CDS  NC_007955  50274  51032  759  peptidase A24B, FlaK-like  YP_564834  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0063    NC_007955  51033  52304  1272      normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0064  CDS  NC_007955  52556  52885  330  hypothetical protein  YP_564835  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0065  CDS  NC_007955  52974  53900  927  aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit  YP_564836  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0066  CDS  NC_007955  53897  54376  480  aspartate carbamoyltransferase regulatory subunit  YP_564837  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0067  CDS  NC_007955  54490  55398  909  cell surface protein  YP_564838  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0068  CDS  NC_007955  55818  58265  2448  plasma-membrane proton-efflux P-type ATPase  YP_564839  normal  0.890371  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0069  CDS  NC_007955  58499  59800  1302  amino acid transporter  YP_564840  normal  0.266806  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0070  CDS  NC_007955  59813  60652  840  amino acid transporter  YP_564841  normal  0.462473  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0071  CDS  NC_007955  61225  61581  357  hypothetical protein  YP_564842  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0072  CDS  NC_007955  61749  62522  774  alpha/beta hydrolase  YP_564843  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0073  CDS  NC_007955  62500  63768  1269  radical SAM family Fe-S protein  YP_564844  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0074  CDS  NC_007955  63798  64532  735  hypothetical protein  YP_564845  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0075  CDS  NC_007955  65008  66039  1032  major facilitator transporter  YP_564846  normal  0.884221  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0076  CDS  NC_007955  66015  66233  219  class H tetracycline resistance efflux protein  YP_564847  normal  0.126523  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0077  CDS  NC_007955  66303  66785  483  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  YP_564848  hitchhiker  0.00144896  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0078  CDS  NC_007955  66871  68085  1215  hypothetical protein  YP_564849  hitchhiker  9.23125e-06  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0079  CDS  NC_007955  68101  69315  1215  cell division protein FtsX  YP_564850  hitchhiker  1.20489e-11  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0080  CDS  NC_007955  69320  70567  1248  hypothetical protein  YP_564851  unclonable  4.12436e-13  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0081  CDS  NC_007955  70587  71309  723  ABC transporter, ATPase subunit  YP_564852  unclonable  3.60668e-15  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0082    NC_007955  72198  72975  778      hitchhiker  0.00467368  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0083  CDS  NC_007955  73103  75394  2292  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  YP_564853  normal  0.172925  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0084  CDS  NC_007955  75833  76459  627  methyltransferase type 11  YP_564854  normal  0.559166  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0085  CDS  NC_007955  76519  77262  744  sugar fermentation stimulation protein  YP_564855  normal  0.675959  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0086  CDS  NC_007955  77293  77628  336  hypothetical protein  YP_564856  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0087    NC_007955  77846  78534  689      normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0088  CDS  NC_007955  78966  79487  522  hypothetical protein  YP_564857  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0089  CDS  NC_007955  79634  79855  222  SirA-like protein  YP_564858  normal  0.741748  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0090  CDS  NC_007955  79908  80288  381  hypothetical protein  YP_564859  normal  0.63908  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0091  CDS  NC_007955  80314  80475  162  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  YP_564860  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0092  CDS  NC_007955  80511  82001  1491  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  YP_564861  normal  0.554506  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0093  CDS  NC_007955  82022  82300  279  fumarate hydratase class II  YP_564862  normal  0.0224877  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0094  CDS  NC_007955  82356  82898  543  succinate dehydrogenase subunit B  YP_564863  hitchhiker  0.00229269  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0095  CDS  NC_007955  83208  85439  2232  DNA topoisomerase I  YP_564864  hitchhiker  3.17173e-08  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0096  CDS  NC_007955  85463  86698  1236  beta-lactamase-like  YP_564865  normal  0.619146  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0097    NC_007955  87125  87733  609      normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0098  CDS  NC_007955  87817  88362  546  hypothetical protein  YP_564866  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0099  CDS  NC_007955  88414  89301  888  serine/threonine protein kinase  YP_564867  normal  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Mbur_0100  CDS  NC_007955  89360  89752  393  hypothetical protein  YP_564868  normal  0.90777  n/a    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea 
 
 
-
 
Page 1 of 25    << first  < prev  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11    next >  last >>