20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0009 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0009  ribonuclease P protein component 1  100 
 
 
101 aa  208  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000469869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0102  ribonuclease P protein component 1  55.34 
 
 
110 aa  111  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.276716  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1720  ribonuclease P, Rpp29  45.45 
 
 
96 aa  77  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000678926  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0718  ribonuclease P protein component 1  45.74 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00304723  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0450  Ribonuclease P, Rpp29  46.74 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0208067  normal  0.676898 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0171  ribonuclease P protein component 1  44.79 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1266  ribonuclease P protein component 1  43.75 
 
 
98 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000002979  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1392  ribonuclease P protein component 1  39.58 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0652  ribonuclease P protein component 1  44.79 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000000274368  decreased coverage  0.0000593448 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0572  ribonuclease P, Rpp29  42.05 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270481  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1836  Ribonuclease P, Rpp29  34.65 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.670408 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1513  Ribonuclease P, Rpp29  40 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.42497e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0540  ribonuclease P, Rpp29  40.23 
 
 
88 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.116302  normal  0.780083 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0486  ribonuclease P, Rpp29  33.33 
 
 
94 aa  57.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2245  ribonuclease P subunit  39.77 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000149463  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2226  Ribonuclease P, Rpp29  37.36 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2441  ribonuclease P protein component 1  40.32 
 
 
152 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.616696 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0802  ribonuclease P  32.56 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.462898 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2300  ribonuclease P protein component 1  36.46 
 
 
103 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0218  Ribonuclease P, Rpp29  36.26 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>